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如何判断bam文件是单端还是双端?

已有 2581 次阅读 2023-2-7 21:05 |系统分类:科研笔记

1,进入R,安装Rsamtools

BiocManager::install(“Rsamtools”)

2,载入Rsamtools包

        library(Rsamtools)

3,读取bam文件

        testPairedEndBam("test.bam")

4,返回结果

若返回TRUE,则test.bam为双端;返回FALSE,则test.bam为单端




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