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堆叠柱状图是我们日常工作中经常使用的一类图形。然而当分类较多时,堆叠柱状图看起来不是那么清晰,通过添加额外的连线,可以增加堆叠柱状图的颜值,给人一种连贯的感觉,并且能够更好地观察数据比例的变化。
图1. 堆叠柱状图(带填充)
如图1所示,这里展示了5个样品的m6A甲基化peak在不同基因组特征上的分布比例,相同类型的基因组特征使用浅色带连接,连贯且有一种伪3D的感觉,让人耳目一新!
1, 打开绘图页面
首先,使用浏览器(推荐chrome或者edge)打开填充堆叠柱状图绘制页面。左侧为常见作图导航,中间为数据输入框和可选参数,右侧为描述和结果示例。也可以在主页搜索框中搜索bar,找到绘图页面。
http://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_vertical_stackbar_with_links_and_fill_plot_038
图2.可视化绘图页面
2,示例数据
点击右侧“示例数据”链接下载excel格式的示例数据。
示例数据(仅供参考)第一行是分类,第一列是样品名。由于这里数值表示比例,因此列的和为100。
图3.输入数据
注意:需要参考示例数据,在excel中将自己的数据整理成示例数据的样式,每个cell都需要有数据。根据数据自行转置。
3,粘贴示例数据
拷贝示例数据的A-F列,粘贴到输入框。
图4. 粘贴到输入框
注意:不是拷贝excel文件,是拷贝excel文件里边的数据。另外粘贴到输入框后,格式乱了没关系,只要在excel中是整齐的就行。并且数据矩阵中不能有空的单元格,中文字符等。
4,修改参数,并提交
我们设置了图片尺寸、文字大小、颜色、字体等参数,基本能满足日常绘图使用。我们提供了10种自定义颜色,让你实现色彩搭配自由(超过10种使用系统默认颜色)。如需更高级的定制,请联系我们。
图5.颜色、字体等可调参数
5,提交出图
粘贴好输入数据,调整好参数(或者全部默认)后,点击提交按钮,3秒钟后,会在页面右侧出现预览图。我们提供了4种图片格式供下载,两种矢量图(pdf,svg)和两种标量图(600 dpi tiff和300 dpi png)。
图6.预览与下载
没有预览就没有出图,这时请参考示例数据,检查自己输入数据的格式。
遇到文字截断,需要修改字体、调整字体大小等,请参考用inkscape编辑svg矢量图
使用inkscape打开svg格式图片,调整图例位置,出血另存为pdf等格式!
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GMT+8, 2024-11-22 17:43
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