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本站一直以来的观点都是:任何在线工具都不能满足你的定制需求,要满足:1,自己编程一行一行写;2,草图+inkscape调整。
例如:有朋友问下面这张BP,CC,MF的图能不能做成BP、CC、pathway?能不能做成两组的?
答复:为什么不能呢?你把pathway的数据贴过去,然后把pathway对应的分类改成MF的分类,提交出张草图,然后用inkscape把MF改成Pathway不就行了吗?(例如下图)
我们规定的是3个,你曲线救国,想画什么分类画什么分类!
两个的为什么不能画,你画好3个的,然后inkscape编辑下,把不需要的删掉就好了么。
所以,inkscape(或者ai),大家一定要用起来。使用inkscape,你就可以在微生信出图的基础上,进行简单调整,然后就可以做出不同花样的图,举一反三。
微生信出的图如果算作“毛坯”,也可以用,但是你经过自己的简单“装修”(装修工具:inkscape)后,会住着更舒服点。
还有朋友问:我这里没有enrichment score怎么作图?
答复:我们在做(模仿)任何一张图之前,都需要先了解X轴是什么,Y轴是什么,点代表什么,线代表什么,颜色表示什么,即所谓的“庖丁解图”(正好管理员叫余丁)。
Bar的高度表示enrichment score,没有enrichment score可以用其他来代替的,比如基因个数,z-score等等,只要是你结果中的一列,而且有意义就行。不要拘泥于示例中的名字,名字是死的,数据是活的。
所以,重要的不是数据可视化,而是分析数据,理解数据背后的意义,然后才能更好地在有限的空间中,形象地展示数据,这样才能达到“一图胜50行excel”的目的。
有朋友跟我说:调图比写英文文章还费劲,这个观点也有一定道理。出张草图谁都会,但是要做的像CNS图片那样漂亮,就需要能写代码,能inkscape编辑,有灵感的人来化腐朽为神奇。
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