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FastQ Screen -- 调查fastq测序数据是否污染
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高通量测序有时会有样品污染，如何判断是什么污染呢？
最简单的做法是把常见的基因组建个索引，然后逐个比对，哪个比对最高，就是哪个污染。
有个软件叫FastQ Screen，替你完成这个工作。
当需要确认来源基因组时，需要针对多个基因组进行比对。针对多个基因组进行比对对检测污染或鉴定样品互换也是有用的，若不检测，可能导致错误的实验结果。
它通过定量比对到一组参考基因组上的reads比例，验证DNA样品来源的工具。FastQ Screen旨在常规地用作一种质量控制措施和分析DNA来源不确定或具有多种来源的样品。
下载：http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastq_screen/
参考：FastQ Screen: A tool for multi-genome mapping and quality control
https://blog.sciencenet.cn/blog-707141-1183268.html
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