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[转载]CircPro -- 鉴定具有蛋白质编码潜能的circRNAs

已有 2488 次阅读 2019-6-5 17:34 |个人分类:软件|系统分类:科研笔记| circRNA, 环状RNA, 编码潜能, 蛋白质 |文章来源:转载

环状RNAs(Circular RNAs,circRNAs)是一类新的内源性RNAs,它们在真核生物细胞中广泛存在。circRNA在各种生物学过程中的新兴作用表明它是RNA世界中一个有希望的关键参与者。

大部分circRNAs是通过pre-mRNAs的反向剪接产生的,形成一个共价闭合环结构,没有5'帽和3' polyaA尾。此外,大部分circRNAs与翻译核糖体不相关,因此认为circRNAs不编码蛋白质。然而,最新的研究发现揭示一些circRNAs能够在体内产生蛋白质,这扩展了转录组和蛋白质组的景观。为了获得对circRNA翻译新领域的见解,我们介绍了一个能够从高通量测序数据中检测具有蛋白质编码潜能的circRNAs的整合工具。

CircPro_workflow.gif


下载:http://bis.zju.edu.cn/CircPro
语言:Perl
时间:20170712
参考:CircPro: an integrated tool for the identification of circRNAs with protein-coding potential



https://blog.sciencenet.cn/blog-707141-1183260.html

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