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当前的基因组浏览器都是通过图形用户界面(graphical user interfaces,GUIs)工作,虽然直观,但是不适合在终端操作,并因此难以整合到脚本中。为了规避这些限制,ASCIIGenome仅通过命令行界面运行,以直接在终端窗口显示基因组数据。
ASCIIGenome容易地与命令行整合,包括数据的批处理,因此能够高效探索数据。
支持一些常见基因组数据类型,并且也可以访问远程ftp服务器上的数据。速度和内存占用与常见基因组浏览器可比或更好。
左边是2个ChIP-Seq峰。右边是比对结果
下载:https://github.com/dariober/ASCIIGenome
语言:Java
时间:20170113
参考:ASCIIGenome: a command line genome browser for console terminals
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