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[转载]DAFGA -- 功能基因扩增子的多样性分析
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功能标记基因的多样性分析提供了对执行生态学相关过程（例如氮固定基因）的微生物基团的生理学见解。然而，由于基因的进化速率不同和水平基因转移事件，将功能基因序列分组为有效分类单元是有挑战性的。
DAFGA以一种标准化方式，通过关联特定功能基因序列趋异和16S rRNA基因序列趋异评估特定功能基因的进化速率。
DAFGA以期望排名为操作分类单元（OTU）聚类和分类分配提供了基因特异性参数集，并且它能够在QIIME提供的多样性测量中实现。
下载：https://github.com/outbig/DAFGA
语言：Python
时间：20140617
参考：DAFGA: diversity analysis of functional gene amplicons
https://blog.sciencenet.cn/blog-707141-1181973.html
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