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Linnorm是用于单细胞RNA测序(single cell RNA sequencing,scRNA-seq)数据分析的一个新的标准化和变换方法。Linnorm被开发以去除技术噪音,并同时保留scRNA-seq数据中的生物学变异,这样能够改进现有统计方法。
显示Linnorm在速度、技术噪音去除和细胞异质性保留中有优势,在新亚型发现,细胞伪时间顺序,聚类分析等中能够改进现有方法。在假阳性率控制和准确性方面,Linnorm也比现有DEG分析方法,包括BASiCS、NODES、SAMstrt、Seurat和DESeq2更好。
下载:http://www.jjwanglab.org/Linnorm/
语言:R
时间:20171006
参考:Linnorm: improved statistical analysis for single cell RNA-seq expression data
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