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随着新的高通量DNA测序技术的发展和递减的成本,大量基因表达数据集正在以加速产生,但是是复杂难以可视化的。需要新的,更加交互和直观的工具以可视化表达数据的时空环境,并帮助阐明基因功能。我们使用番茄果实作为一种模式植物,开发了番茄表达地图(Tomato
Expression
Atlas)以促进高效数据分析,除了候选基因鉴定外,还允许在细胞/组织分辨率水平上同时可视化一个器官中的成组基因,增强了假设发展和测试。这个地图能够适应来自多种多细胞物种的不同表达数据。
网站:http://tea.solgenomics.net/
源码:https://github.com/solgenomics/Tea
时间:20170329
参考:The Tomato Expression Atlas
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