博文
[转载]HiCUP -- 比对和处理Hi-C数据的流程
||| |
Hi-C和捕获Hi-C是研究基因组三维组织的技术，HiCUP是一个处理由Hi-C和捕获Hi-C（Capture Hi-C，CHi-C）产生的测序数据的流程。
流程比对数据到一个指定参考基因组，并去除可能阻碍随后分析的假象。HiCUP也产生一个易于解释，但详细的质控（quality control，QC）报告，它帮助改善实验方案以用于未来研究。
下载：http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/hicup/
语言：Perl
时间：20151120
参考：HiCUP: pipeline for mapping and processing Hi-C data
https://blog.sciencenet.cn/blog-707141-1166994.html
上一篇：[转载]LinkageMapView -- 渲染高分辨率连锁图谱和QTL图谱
下一篇：[转载]Splatter -- 模拟单细胞RNA测序数据
