|||
众所周知,miRBase是miRNA研究的金标准数据库。但是,自2014年6月以来,就没有更新过(文章中这样说的,具体没有查)。那么,这3-5年以来,所有新miRNA预测文章就有可能有很多新miRNA是冗余的。正是因为没有一个统一的数据库,所以出现了这些问题。
这里,我们介绍一个新数据库,miRCarta,算是miRBase plus版。
它包含了miRBase的所有内容。还添加了许多新内容。
miRNA数目更多
信息更丰富:名字,序列,基因组位置,靶基因,通路,高通量测序表达值,实验证据等等。
并带有miRNA ID转换,miRNA blast,靶基因预测等等。
研究miRNA的可以转到这个数据库上了。
参考文献:miRCarta: a central repository for collecting miRNA candidates
数据库地址:https://mircarta.cs.uni-saarland.de/
Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )
GMT+8, 2024-11-23 12:38
Powered by ScienceNet.cn
Copyright © 2007- 中国科学报社