微生信分享 http://blog.sciencenet.cn/u/chinapubmed 0代码在线绘制160+科研图

博文

我来给“最强大脑”出个题:虚拟/增强现实3D大分子“乐高”挑战

已有 3631 次阅读 2017-8-14 17:25 |个人分类:生物信息|系统分类:教学心得| 虚拟现实

前段时间迷上了“最强大脑”。不光选手惊人,道具也惊人。各种高科技,各种眼花缭乱。


记得有个“仓颉造字”和“乐高”的(具体选手名忘了)。


仓颉造字使用了虚拟现实技术,乐高那个考验的是超强记忆。


今天我们把两者结合起来,让选手在虚拟/增强现实环境下,找出3D大分子中哪个原子被拿掉了!


道具1:某蛋白质的pdb文件。例如1aew。其结构为:



大概1k个原子。闲不够多的话,可以用更大的蛋白质,有几十万,甚至更大的蛋白质(比乐高那个8万个元件多就行)


道具2:转成VR 3D模型


这里用到一个网站:http://152.1.118.161/realityconvert.com/,它可以把pdb文件转成兼容VR设备的3D模型。


大概是这个样子的:



我穷人没用过VR,只能想像下。


步骤:

1,找个包含10w+个原子的蛋白质pdb文件,先用道具2转成VR兼容的3D模型(估计它不一定能处理这么多原子,仅仅给个思路啊)。然后让选手头戴VR设备,看下巨大的蛋白质3D模型。amazing!




2,编辑该pdb文件,拿掉几个原子(这里先不考虑完整性啦)


3,再使用道具2将拿掉原子的pdb文件转成VR兼容的3D模型,重新展示给选手



4,找吧,哪个原子被拿掉了?


思路跟那个乐高的一样。

几万个原子的不够,来个几十万的;一个蛋白质不够,来100个试试(你想把人玩死吗?)。


科学也可以玩的,增强现实和虚拟现实技术令人身临其境,为研究和教学提供了前所未有的机会,希望更多的虚拟/增强现实技术应用到生物信息学和化学信息学中。


最后再来张动态图。





https://blog.sciencenet.cn/blog-707141-1071077.html

上一篇:环状RNA(circRNA)真的像夏天一样“热”吗?
下一篇:用图形展示miRNA-seq中检测到的miRNA和未检测到的miRNA
收藏 IP: 101.81.77.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...
扫一扫,分享此博文

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-11-23 04:07

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部