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AI4Science 获诺奖

已有 439 次阅读 2024-10-10 16:56 |个人分类:科研笔记|系统分类:科研笔记

2024108日,2024年度诺贝尔物理学奖授予了美国科学家约翰·霍普菲尔德(John J. Hopfield)和英裔加拿大科学家杰弗里·辛顿(Geoffrey E. Hinton),以表彰他们1980年代在人工神经网络机器学习方面的基础性发现和发明。

时隔一天,109日,2024年度诺贝尔化学奖授予了美国生物化学家戴维·贝克(David Baker)和英国人工智能(AI)科学家德米斯·哈萨比斯(Demis Hassabis)和美国科学家约翰·江珀(John M. Jumper),以表彰贝克在计算蛋白质设计方面的贡献和哈萨比斯(Demis Hassabis)与江珀(John M. Jumper)在蛋白质结构预测方面取得的成就。

如果说翰·霍普菲尔德是模拟人脑神经网络发明了一个人工神经网络,辛顿发明了人工神经网络的训练算法,那哈萨比斯和江珀就完全是利用人工神经网络解决了一个科学问题。是典型的AI4Science。顺便说一句,江珀1985年出生,赖以获奖的AlphaFold 2018年问世的。

2024诺贝尔物理学奖和化学奖预示AI4S( AI for Science)时代的到来,同时AI将深刻改变科学研究的范式——AI4Science

综合网络资料:2024年度诺贝尔物理学奖和化学奖获奖者的贡献如下:

      约翰·霍普菲尔德(John Hopfield )是一名研究领域很宽的理论物理学家,早期的工作是在凝聚态物理方面,后又在生物化学领域耕耘。1982年,Hopfield 发表题为"Neural networks and physical systems with emergent collective computational abilities""具有涌现集体计算能力的神经网络和物理系统")的论文。这篇论文提出了一个不同于 perceptron 的神经网络模型,各神经元互相连接(作用),非同时更新,能够学习并模拟计算。这个模型是从统计物理学的角度构建了一个分布式的物理学系统。这个模型基于系统局部能量最低点,可以说是零温度模型。

杰弗里·辛顿(Geoffrey E. Hinton )更为人知的是AI教父,发明了机器学习领域的backpropagation 算法。辛顿学术江湖地位的奠基性论文是 “A Learning Algorithm for Boltzmann Machines” 1985)。辛顿与合作者一起将 Hopfield 模型进行了发展,提出了 Boltzmann machine (波尔茨曼机器),通过引入温度的概念解决了神经网络训练易陷入局部最优的问题。辛顿最为难能可贵的是在许多大家都不看好的领域持续耕耘30年,终有所成。辛顿发展的深度学习方法已被运用于物理、化学等领域,解决了很多以前人们认为 intractable 的计算问题,如蛋白质折叠(2024年哈萨比斯和江珀因此获得诺贝尔化学奖)。

戴维·贝克(David Baker)的贡献主要在于蛋白质设计。自然界中的蛋白质种类有限,研究人员希望创建出新的蛋白质种类,使其执行诸如分解有害物质或作为化学制造业工具等功能。该领域自20世纪90年代末兴起,贝克的突破性贡献是开发了一个名为Rosetta的蛋白质设计软件,借助该软件能构造出自然界不存在的全新蛋白质。贝克的研究团队首先提出一个全新结构的蛋白质,然后利用Rosetta计算哪种氨基酸序列可以生成所需的蛋白质。为了验证该软件的成功率,贝克的研究小组将软件建议的氨基酸序列基因引入细菌,这些细菌生产了所需的蛋白质。然后,他们利用X射线晶体学确认了蛋白质结构与他们的设计几乎完全符合。该成果于2003年发表。此后,他的研究小组不断创造出一个又一个具有新功能的蛋白质,可用于催生新的纳米材料、靶向药物、疫苗研发、微型传感器以及更环保的化学工业等,为实现人类福祉开辟了无限可能。

     德米斯·哈萨比斯(Demis Hassabis)和约翰·江珀(John M. Jumper)的贡献是用人工智能预测蛋白质三维结构。蛋白质是维持生命的重要大分子,是构成骨骼、皮肤、头发等组织的基石,是驱动肌肉的马达,是读取、复制和修复脱氧核糖核酸(DNA)的机器,是让大脑中神经元随时准备运转的,是促进机体免疫反应的抗体,是细胞向外界传递信息的传感器,是调节人体内所有细胞的激素。蛋白质通常由20种不同的氨基酸组成。在蛋白质中,氨基酸以长链连接在一起,折叠起来形成独特的三维结构,这对蛋白质的功能至关重要。要了解生命如何运作,首先就需要了解蛋白质的形状和结构。自19世纪以来,化学家就已了解蛋白质对生命过程的重要性。但直到20世纪50年代,随着研究工具精度的提高,研究人员才开始借助仪器解析蛋白质三维结构。到20世纪70年代,研究人员已经认识到,决定蛋白质如何折叠的相关信息蕴含在组成蛋白质的氨基酸序列中。从那时起,研究人员一直怀有一个梦想,即试图根据已知的氨基酸序列预测蛋白质三维结构,但这非常困难,甚至一度被认为是不可能实现的梦想。2020年,谷歌旗下DeepMind公司的德米斯·哈萨比斯和约翰·江珀提出名为“AlphaFold 2”的人工智能模型极大缩短了人工确定蛋白质结构的时间,成功解决了科学家苦苦思索了数十年的难题——从氨基酸序列预测蛋白质结构,这同时展现了人工智能对于科学发现的影响。借助AlphaFold 2,科学家能够预测几乎所有已知的2亿种蛋白质的结构。



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