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Cell——研究揭示MS风险基因IL7R 6号外显子的上位调控机制
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Cell——研究揭示MS风险基因IL7R 6号外显子的上位调控机制
IL7R的6号外显子的选择性剪切受另一个SNP调控
基因多态性是最常见的遗传变异，目前在各个疾病系统中都得到了广泛的研究。在AD中，目前已经发现了30多个基因多态性与晚发性AD的发生相关；在PD中，与散发性PD发生相关的单核苷酸多态性也不在少数，在MS中也是一样。所以，疾病的发生很有可能决定于一系列的基因多态性的组合，也就是说，有些疾病的发生，不仅仅受到单个SNP的影响，还受到其他SNP的影响，最终疾病的发生风险有多大，排除了环境因素之外，就决定于SNP组合的取值情况。这与神经元动作电位发生的概率决定于突触前的时间总和和空间总和是很相似的。疾病的发生状态是一种贝叶斯概率，其决定于所携带的各种SNP，包括促进疾病发生的SNP和抑制疾病发生的SNP的综合效应。在MS中，IL7R是MS的风险基因，但是它本身还受到其他基因的调控，也就是说这里存在基因多态性之间的相互调控和协作，这是一种状态变量，最终MS发生的概率可以用公式P=P(IL7R/other SNPs)表示，也就是说IL7R引起MS的概率是在其他SNP发生状况下的贝叶斯概率。在最近的Cell文章中，科学家发现了DDX39B可以调控IL7R的水平，从而影响MS的发生。在这种情况下，一个SNP是否会发挥作用取决于另一个SNP的状态。想到这里，要想确切知道一个SNP的疾病风险，那是需要把其他SNP的状态考虑在内的，这或许是我们目前很多遗传学研究不够准确的原因之一吧！
1. DDX39B调节IL7R 6号外显子的选择性剪切
2. DDX39B周围的基因位点和MS的发生密切相关
3. DDX39B 5'-UTR的rs2523506调节其蛋白表达水平
4. rs2523506能够降低DDX39B转录的效率
5. DDX39B和IL7R之间的相互作用
6. DDX39B调节原代CD4+T细胞中IL7R的表达
总结
这项研究揭示了DDX39B调控IL7R 6号外显子表达水平的调控机制，为我们认识MS中基因相互作用调控机制提供了非常宝贵的研究证据。
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