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你还在为外泌体Western blot选择那些指标蛋白而苦恼吗?
有了指标蛋白你又在为选择哪个公司的抗体而困惑吗?
选好了抗体,你还在为阳性参照而发愁吗?
是否还在纠结用什么做内参吗?
让我们走进文献,为你分析问题寻求方向!
1)外泌体Western blot鉴定时通常会检测哪些指标蛋白?
根据22篇外泌体相关文献的统计,排在前4位的检测指标为CD63(13/22)、Tsg101(8/22)、 CD9和CD81并列第三位(6/22);接着检测较多的4个指标为Alix(4/22)、 HSP70(3/22)、 flotillin (3/22)和Syntenin (2/22);此外还有一些指标仅在1篇文献中出现过,例如HSP90、LAMP2B、LMP1、ADAM10、nicastrin、AChE、AQP2、RPL5、a-1AT。
针对外泌体的定性检测至少选择两个指标就能满足文章发表需要了,比如检测CD63和Tsg101。
2, 外泌体Western blot鉴定时通常使用哪些公司的抗体?
CD63 抗体的供应商:文献报道最多的两个公司Abcam (ab68418和ab8219) 和Santa Cruz (sc-5275),其他公司有Systems Biosciences Inc、Abnova (clone MEM-259)、BD Pharmingen (551458)。
Tsg101抗体的供应商:文献报道最多的两个公司Abcam(ab125011)和Santa Cruz (sc-7964),其他公司有Thermo Pierce和Sigma-Aldrich。
CD9抗体的供应商:文献报道最多的是Abcam (ab92726),其他的公司有Santa Cruz和Systems Biosciences Inc。
CD81抗体的供应商: 文献报道最多的是Santa Cruz (sc-9158和H-121),其他的公司有Novus Biologicals (Cat# NB100–65805)、ImmunoWay。
Alix抗体的供应商:文献报道的公司有Cell Signaling (#2171)、Santa Cruz、Abcam。
HSP70抗体的供应商:文献报道的公司有Abcam (ab19136)、Santa Cruz (sc-24)。
flotillin抗体的供应商: 文献报道的公司有BD Bioscience。
Syntenin抗体的供应商:文献报道的公司有ThermoFisher Scientific (Cat# PA5-28826) 和Abcam (ab133267)。
其他抗体信息请查阅附录整理的文献资料。
3, 外泌体Western blot定性检测中有没有阳性对照?
从发表的文章来看,并没有一篇文章结果中提到了阳性对照样品,但是已经被文献报道的样品可以作为后人Western blot检测实验的阳性对照,通过这样阳性样品的检测来判断实验体系是否正常。罗列一下文献中的阳性对照样品:脂肪组织巨噬细胞外泌体、神经干细胞外泌体、大鼠皮层神经元外泌体、SCC-9和Cal-27细胞外泌体、MDA-MB-231外泌体、星型胶质细胞外泌体、中性白细胞外泌体等。
4, 外泌体Western blot定性检测中有没有内参?
大部分文献中没有检测内参基因(19/22),个别文章中使用了Actin、GAPDH和Tubulin作为内参进行检测(见下图),从检测的结果来看,外泌体中的Actin、GAPDH和Tubulin的表达丰度相对于正常细胞样品中的较低,Western blot检测时可能会检测不到任何条带或者条带微弱。
更多资料请点击下载:外泌体Western Blot结果文献数据汇总
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