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狼真的来了吗？——系统生物学简介（1）
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最近几年大科学和小研究之争时有所闻，似乎各有各的道理。空间科学高能物理之类要有新的突破，要花的大钱就是美国也觉得奈何不了，有些项目只得刚开始就不得不下马，前期数亿美元只当交个学费，最后还得联合多个国家一起来搞，各位只要在科学网看看就知道我说的是什么项目了。我理解，这类项目只是钱的问题，并不是技术方法的可行性科学性等没有解决。但如果要将这类大项目操作模式用于生物医学方面的研究，我以为除了基因组测序外，其他方面还是很难有显著的效果的，如系统生物学方面的研究，这主要是目前技术上不成熟，理论上也没有新的突破。
先看系统生物学理论上的基本观点，可以归为“老三论”（系统论、控制论和信息论），加上一点点”新三论“（突变论、协同论、耗散结构论），这些理论描述生命运动的本质特征是否够用，谁也没有把握。
再看技术上的问题，在生物医学研究的各个层次领域，分析方法仍然占主导地位，所谓的综合只是将这些零件按照物理化学原则组装一下，这种方法阐明结构问题可能还行，但要说明生物医学现象的功能机制则是要大打折扣的。功能基因组学、蛋白质组学等高通量的技术目前在有限的模式生物上得到了初步的应用，还有许多实验技术问题无法解决，特别是蛋白质组学技术，要解决的问题过多。这些技术要推广应用到非模式生物还有很长的路要走（目前，国内有牛人领衔搞肝细胞蛋白质学研究，也是基于系统生物学原则，前后投入的钱据说也是数亿，但愿能够有所突破！）。如本人搞的日本血吸虫病的研究，人工培养虫子（或细胞）完成生活史周期目前就做不到，很多功能方面的研究没有办法做。加上在体内同时测定多个参数基本上还做不到，等等等等。。。。。。怎么可能得到一幅真正系统水平的图像呢？
当然，我们还是要进行这方面的研究的，否则，就永远不能获得系统生物学方面的知识了（近年来，我们课题组也在进行血吸虫功能基因组学方面的工作，也用到了一点点系统生物学的概念，试图在血吸虫WNT信号传导网络的分子机制及其生物学功能方面做点初步工作。）；并且技术问题，只有在做的过程中才能慢慢得到合理的解决。但是不能过分强调这门学科成熟了，会有很大的进展，更不能为了立大项目炒作系统生物学概念。毕竟时机不成熟。
最后，说几句不怎么鼓劲的话，几乎是在一个世纪以前，贝塔朗菲（见附件我的PPT）就想搞系统生物学，也热了几下子，但最后只能成为一种哲学思想留下来；人类有时候应当在自信和自卑中找到一种平衡，生物医学科学研究也是如此，因为，毕竟”理论是灰色的，而生命之树常青“！系统生物学简介1
https://blog.sciencenet.cn/blog-64967-46718.html
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先看系统生物学理论上的基本观点，可以归为“老三论”（系统论、控制论和信息论），加上一点点”新三论“（突变论、协同论、耗散结构论），这些理论描述生命运动的本质特征是否够用，谁也没有把握。
再看技术上的问题，在生物医学研究的各个层次领域，分析方法仍然占主导地位，所谓的综合只是将这些零件按照物理化学原则组装一下，这种方法阐明结构问题可能还行，但要说明生物医学现象的功能机制则是要大打折扣的。功能基因组学、蛋白质组学等高通量的技术目前在有限的模式生物上得到了初步的应用，还有许多实验技术问题无法解决，特别是蛋白质组学技术，要解决的问题过多。这些技术要推广应用到非模式生物还有很长的路要走（目前，国内有牛人领衔搞肝细胞蛋白质学研究，也是基于系统生物学原则，前后投入的钱据说也是数亿，但愿能够有所突破！）。如本人搞的日本血吸虫病的研究，人工培养虫子（或细胞）完成生活史周期目前就做不到，很多功能方面的研究没有办法做。加上在体内同时测定多个参数基本上还做不到，等等等等。。。。。。怎么可能得到一幅真正系统水平的图像呢？
当然，我们还是要进行这方面的研究的，否则，就永远不能获得系统生物学方面的知识了（近年来，我们课题组也在进行血吸虫功能基因组学方面的工作，也用到了一点点系统生物学的概念，试图在血吸虫WNT信号传导网络的分子机制及其生物学功能方面做点初步工作。）；并且技术问题，只有在做的过程中才能慢慢得到合理的解决。但是不能过分强调这门学科成熟了，会有很大的进展，更不能为了立大项目炒作系统生物学概念。毕竟时机不成熟。
最后，说几句不怎么鼓劲的话，几乎是在一个世纪以前，贝塔朗菲（见附件我的PPT）就想搞系统生物学，也热了几下子，但最后只能成为一种哲学思想留下来；人类有时候应当在自信和自卑中找到一种平衡，生物医学科学研究也是如此，因为，毕竟”理论是灰色的，而生命之树常青“！系统生物学简介1
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