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有效的干实验预测蛋白结构工作
杨顺楷 密西根州兰辛市一社区
据2014年冬MSU自然科学学院新闻快报报道,该学院生物化学与分子生物学教授(Associate Prof)首席网络人士Michael Feig 及其团队在蛋白结构预测比赛中获头奖。蛋白纯化及其结构预测在当代药物设计的医药工业中具有重要意义。
通常,借助实验室技术进行预测蛋白结构工作,即所谓的“湿实验”传统方法进行工作,实验步骤非常繁复,花费成本高,耗时费工,且常常不能获得预期正结果。伴随计算机及网络数字技术的发展,结构生物学家们长久以来一直致力于使用计算机手段对多种蛋白进行结构预测。正如Dr. Feig 所说:“我们对蛋白结构了解得更详细,那么就能更好地了解这些蛋白的功能”, “如果你有一个非常接近正确答案的初始模型,那么就可以避免许多问题。” 但是在过去预测蛋白结构的干实验工作成功率不够高,比较费时费力;然而现在有效的预测蛋白结构工作取得快速进展。
现在,Michael Feig 及其团队在蛋白结构预测利用计算机及网络数字技术手段取得了很大的进步。借助已经建立起来的这一套程序,在选择合适蛋白初始模型进行精细结构预测,可以达到传统实验室方法作蛋白结构测定水平。最大的优势是显著降低了蛋白结构预测花费的时间,从原来的6个月缩短到1或2个月,工作效率大为提高。
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GMT+8, 2024-12-22 13:59
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