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除Rosetta外,还有很多,列表备查。
towhee
http://towhee.sourceforge.net/
老牌经典mc程序,没用过。
http://robotics.stanford.edu/~itayl/mcs/
相对简单的一个mc程序,代码清晰(但不符合标准c,编译出问题)。包含基本的rotamer还有eef1溶剂模型实现。
http://cbbp.thep.lu.se/activities/profasi/
高效的主链采样,粗粝模型。
http://www.phaistos.org/home/Main_Page
比较新颖的基于统计模型的主链生成算法。可以用于结构预测。
最后来一个wiki列表 https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_software_for_Monte_Carlo_molecular_modeling
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