Rosetta 是学术免费且开源的程序，编译安装使用简便，而且很容易自行添加新功能。

1. 到这个网站 https://www.rosettacommons.org/ 注册一下就可以下载最新版本的源代码。

压缩包里应该包括source, database, tests三个文件夹：

source 是源代码

database是运行时需要的参数文件

tests包含一些测试的代码和数据

2. 编译进入source文件夹：

编译debug 版本

       ./scons.py bin -j 8

编译release版本

       ./scons.py bin mode=release -j 8

编译mpi版本

       ./scons.py bin mode=release extra=mpi -j 8

Rosetta使用scons进行自动编译，-j表示用多少个核来并行编译。一般默认的编译设置就可以，有时根据系统环境不同需要进行一些特殊路径的修改，在tools/build下有配置文件。

3. 在debug版本编译好后可以运行test（可选）：

编译unit test并运行测试

       ./scons.py cat=test

       python test/run.py -d /path/of/database --mute all -j20

4. 结束后，在source/bin下会出现所有的可执行文件

（编译时其实不用全部编译，可以指定，比如： ./scons.py score_jd2 mode=release -j8）

其他相关的程序和网站：

Robetta

Rosetta的从头预测以及同源模建等都非常费时，因为像掷色子，一般需要掷个上万个点才能有比较好的信号，在个人电脑上很难完成，这时可以把需求提交到Robetta服务器上，它利用全球分布式科学计算boinc的服务，利用无数个人电脑的闲置cpu时间来帮助完成科学计算。

Rosetta@home

如果你的个人电脑有大把闲置时间，比如晚上，不妨下载一个boinc，它会在你机器闲置的时候运行一个类似屏保的东西，帮助科学家进行计算。上边有很多不同的项目，天文地理生物什么都有，推荐选Rosetta，你可以看到程序动态采样一个蛋白的过程。

Foldit

这是一个电脑游戏，但游戏的内容是折叠一个真实的蛋白，不像Rosetta直接扔色子，它提供了非常方便人机交互工具，玩家可以根据自己的直接手动来折叠一个蛋白并由程序打分，和其他玩家pk。这个游戏真的可以解决悬而未决的科学问题，比如解蛋白结构，有nature文章为证。

PyRosetta
如果你只是想了解尝试一下，或者只会用windows，可以试试预编译好的版本，用python脚本调用Rosetta的api来进行一些简单操作，而且可以用pymol可视化运行的过程。