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2021年7月27日,中国科学院上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究员团队在The Plant Journal杂志发表了题为MSI4/FVE is required for accumulation of 24-nt siRNAs and DNA methylation at a subset of target regions of RNA-directed DNA methylation 的研究论文,文章研究发现开花调节因子FVE 在RdDM 发挥着重要作用,参与调控DNA 甲基化和siRNA 积累。
DNA甲基化是一种重要的表观遗传标记。在植物中,从头DNA 甲基化主要通过RNA 指导的DNA 甲基化 (RdDM) 途径发生。研究人员之前的研究推断,开花调节因子MULTICOPY SUPPRESSOR OF IRA1 4 (MSI4)/FVE参与了多个RdDM 靶点的非CG 的甲基化,这表明了FVE 在RdDM 途径中的作用。但是,在全基因组上,FVE 是否以及如何影响RdDM 依赖的DNA 甲基化尚不清楚。
本研究了数千个RdDM 目标区域的DNA 甲基化需要FVE。此外,FVE 功能障碍会显著减少依赖于RdDM 途径下游因子的 24-nt siRNA 的积累。通过使用染色质免疫沉淀测序 (ChIP-seq),研究发现FVE 直接与FVE 依赖的 24-nt siRNA 簇区域结合。研究结果还表明,FVE 可能通过与RdDM 途径下游因子RDM15 物理的相互作用,从而在RdDM 中发挥作用。
FVE and RDM15 corporately regulates DNA methylation at some RdDM target loci.
综上,本研究表明,FVE 通过与RDM15 相关联,能够直接参与调节部分RdDM 靶标的 DNA 甲基化和siRNA 积累。
原文链接:https://doi.org/10.1111/tpj.15441
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GMT+8, 2024-11-29 20:36
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