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R/Bioconductor与转录组数据分析（1）
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一、各种安装：
重要：R语言中是严格区分大小写的！
安装包package的CRAN镜像站：可以选China(Lanzhou)[https] 。
1、安装R，https://cran.rstudio.com/，目前的版本是3.5.1，安装后在R或RStudio启动时会显示，R的各种包对版本的要求比较严格，要留意。
2、R中有类似于SPSS的界面：Rcmdr，通过菜单方式操作，但我在macOS Sierra 10.12.6和Windows 10中没有安装成功，其它的可以试试。
3、安装RStudio，https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/#download
Free部分已经完全够用了，感谢 RStudio的开发人员！
4、Bioconductor包的安装，http://www.bioconductor.org/install/
现在Bioconductor包的安装方式有所改变，是：
if (!requireNamespace("BiocManager"))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install()BiocManager::install() <- 括弧里是要安装的包的名称，如果是留空，表示安装核心包。
网站的说明：
Install Bioconductor Packages
To install core packages, type the following in an R command window:
if (!requireNamespace("BiocManager"))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install()Install specific packages, e.g., “GenomicFeatures” and “AnnotationDbi”, with
BiocManager::install(c("GenomicFeatures", "AnnotationDbi"))后面还有其它说明，如查看已经安装的包，更新包，etc。
#最适合于还阅读本文的初学者的一本书《R常见问题解答》
二、RStudio简介（to be continued）
https://blog.sciencenet.cn/blog-62701-1149302.html
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