||
QIIME 2 2021.2 版本现已推出!感谢所有参与者的辛勤工作!
提醒一下,我们下一个计划发布的QIIME 2计划于2021年4月发布(QIIME 2 2021.4),但请继续关注更新。
查看QIIME 2 2021.2 文档 16有关安装最新QIIME 2版本以及教程和其他资源的详细信息。如果您遇到任何问题,可以联系QIIME 2论坛!
虚拟机将在下周的某个时候提供!
classify-sklearn
:参数的默认值已更改为不允许。如果您将参数明确指定,则需要将其更改。如果你没有明确设置这个参数,那么你没有什么可担心的!reads_per_batch
0
"auto"
0
reads_per_batch
0
"auto"
0
请根据需要更新脚本、工作流程等。卡住了?在论坛上寻求帮助。
做了一些与API相关的更改,这仍然是一个正在进行的工作,关于这很快有更多!
重新构想驱动程序采取更惯用的方法-DiagnosticUsage
向基本驱动程序添加了缺少的API方法()
将动作助手注入基础驱动程序
在帕金森鼠教程中修复了一两个拼写错误
更新我们的文档repo,以适应Sphinx更新引入的新要求。
q2cli
重构此界面的使用 API 驱动程序,以采取更惯用的方法 - API 仍然是一个正在进行的工作,更多关于这很快!
q2-types
重新构件成一个更一般的,应该简化新的序列格式(如RNA)的添加,并派生他们的版本DNAFASTAFormat
FASTAFormat
Aligned
添加了一个新的和相应的类型,用于蛋白质分析-第一个插件(s)这些都在进行中ProteinFASTAFormat
ProteinSequence
如果是过滤后反向坐标轴上零频率的假特征/样本,则不会删除。filter-opposite-axis
filter-samples
filter-features
filter-opposite-axis
添加了并启用了处理s.average
overlap_method
merge
merge
RelativeFrequency
FeatureTable
更新转换器,使用视图api转换为FeatureData[Sequence]
pandas.Series
添加,使使用ILR变换对进化树进行无监督的分析ilr_phylogenetic_ordination
添加到差异丰度工具,如Songbird和Aldex2,通过ILR转换转换为进化坐标。ilr_phylogenetic_differential
Differentials
有关如何使用这些命令的附加教程可以在 empress github repo 找到
在我们的各种https://github.com/qiime2存储库中自动增加版权年数。
从TravisCI 迁移github.com/qiime2存储库并迁移到 Github
修复了一个错误,阻止我们在网站上创建新的workshops条目。
更改了主页上的排序逻辑,允许将长期运行的研讨会列为即将举办的研讨会,而不是"过去"
*
有关详细信息,请参阅中断更改部分。
对操作进行了改进,以便在使用时更加清楚。classify-sklearn
"auto"
reads_per_batch
提供了一个很好的元数据验证增强功能,以便当元数据中存在 NaN 时,会出现用户友好型错误。
快乐的
Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )
GMT+8, 2025-1-9 05:05
Powered by ScienceNet.cn
Copyright © 2007- 中国科学报社