植物“单细胞”代谢组学是指通过特定的分析方法，无偏检测单个细胞中的所有次生代谢小分子产物（分子量小于2,000 Da），如单个表皮细胞；“单一细胞群”代谢组则是指具有共同起源和承担相同生理作用的某一类细胞群中的次生代谢产物，如毛状体、保卫细胞。目前已知植物中的次生代谢产物数量约200,000种，单个物种中含有约7,000-15,000种，而叶片中存在约3,000-5,000种。由于次生代谢产物一般分布在特定的细胞中，器官和组织水平（混合细胞类型）代谢组往往存在“稀释效应”（dilution effect）或“均一化”（averaging effect），并不能真实反映细胞内的次生代谢途径和代谢网络。Misra等近期从三个方面综述了单细胞代谢组方面的研究，包括单细胞代谢组样品制备的技术方法，代谢组分析方法，以及单细胞和单一细胞群代谢组的具体应用。

   国内类似的研究在香港浸会大学赵中振教授实验室比较成熟（http://scm.hkbu.edu.hk/tc/expertise/faculty_staff/full_list/index_id_4.html）。

Misra, B. et al. 2014. Plant single-cell and single-cell-type metabolomics. Trends in Plant Science, DOI: 10.1016/j.tplants.2014.05.005