每年通过新疆上空的水汽超过1万亿立方米，但大部分只是过境，西、北、南为输入界面，东为输出界面，只有1/5左右转化为降水，每年全疆降水有2000多亿立方米，大部分在山区，其中1/3形成了超过800亿的地表和地下水资源，高山区径流系数大于0.5（当然张学文先生是这方面的权威）
新疆水资源最大的损失可能是降水在无植被覆盖地面上形成的蒸发。新疆无植被覆盖的沙漠、戈壁、裸石、裸土山地以及冰川占全疆总面积的一半以上，除冰川可以形成径流外，裸地上大部分降水无法为生态系统和人类经济社会利用，准噶尔盆地底部荒漠草原和草原化荒漠的降水利用效率也很低。

这部分降水损失每年至少有几百亿立方米，可能占全疆总降水量的20%-30%，而且在可以在可以预计的将来人类也注定无法利用。