（1）形成研究思路。通常等学生做完了一个小研究，发表了一篇中文论文后，作为导师就要考虑指导学生开展下一个研究，撰写并发表一篇SCI论文工作了。之初导师要和研究生谈几次选题、思路、想法，从国家发展需要，行业发展需求，从正在开展研究项目着眼，在这些前提框架下，天马海空，高谈阔论地侃上几次，做几次头脑风暴，以聊嗨为主，主要是燃起热情与好奇心，培养气氛和正能量，积攒干劲为主。

要让研究生明确知道自己要做研究的整体研究框架是什么样的，给出具体研究方向、目标和内容。期间，导师下载一些文献给学生看，或者给学生几个关键词，让他们自己下载论文并学习之。让他意识到自己正在做一件非常有趣、非常有意义、非常有用，但有一些难度的研究，心里充满了力量，脑子里有具体方法和步骤。

这个阶段重点是明确这个研究创新点在哪里，意义在哪里，让学生明确为什么要做这个研究，做这个研究有什么用。如果没有创新，没有贡献，没有新意，宁愿不要开展下一步工作，否则出力不讨好，费功夫没有多大收获，因此，一定要想明白了再朝下走。在读文献过程中，让学生了解前人已经做了哪些研究，具体形成了那些认识，还有哪些问题尚不清楚，需要继续开展研究工作，而我们这次要做的研究，在整个研究框架中处于什么位置。最后，提出整个研究的框架，准备一个即将撰写的论文提纲，明确论文的核心科学问题，论文中几幅重要的图具体是什么情况。

（2）确定研究方案。先后谈几次之后，学生思路也算清楚了，就是搜集文献、阅读文献，丰富、完善研究方案。研究方案要非常的全面和细致，当然，随着研究推进还会不断的修改和改造，并非一成不变的。其中，研究关键科学问题、研究观测试验方案、数据分析方法等，这些是比较关键的问题，一定要明确下来。另一个重要的事情是，在读文献的时候要写一个比较好的读书报告，通常要两万字以上。将领域主要研究都要有个梳理、总结和归纳，这是基本功，也是必须要走的路，不读文献一切从何谈起。这个时候，通常会出现一些美妙的幻想，幻想自己的研究做完后，论文能发表在哪些早已心仪已久的刊物上。

（3）数据获取与分析。接下来就是研究方案的实施工作，包括共享/已有数据搜集整理，野外采样和观测，样品室内分析测试等。这个阶段是实质性的操作层面，花钱又要花精力，师生之间需要反复讨论，灵活机动的调整，导师要跟踪指导，适时调整研究方案。这个过程如果疏忽指导，最后拿到的数据可能会让导师头大、爆炸、几乎疯了，死的心都有。掌握数据后就是分析数据，要按照故事脉络或论文行文层次，作出一系列的图件和表格。单看图件和表格就能串起整个研究的故事，形成论文的整体脉络。

论文图表准备工作是一个长时间过程，要反复分析和制图，而且现在比较好的刊物，有对图表越来越重视的趋势。论文中能出现几幅让人耳目一新的炫图，是一篇论文能发表和日后被广泛引用的重要砝码。根据研究数据、研究需要，结合不断的文献阅读，要反复不断地修改图件，绘制新图件。这时候导师要和学生多次逐张图件、逐个表格的讨论，讨论过程也是研究问题的认识过程，也是研究结果表述和结论形成的过程。等反复讨论多次，论文图表都完成的时候，整个研究的故事概况也就明晰明了了。

（4）大面上指导论文写作。论文写作是个系统工程，一开始导师要从大面上指导，不宜在具体词句细节上指导，先讲战略后讲战术。要和学生反复交流几次，确定论文提纲，明晰每个部分要写什么内容。等学生写完初稿或者毛坯稿的时候，在大处着眼继续指导，对论文初稿进行调整。要让整个论文结构圆润，逻辑严密，不能有硬伤，而且师徒两个人要形成共识，是两个人都认同的论文初稿。这个阶段要阅读相近的论文，学习人家的论文结构和表达方法，遵循领域内表述传统。这个过程往往很慢，不仅有语言问题，而且也是一个对研究问题认识深化的过程，论文结构会反复调整，期间还会有图表更新、增补等工作加入。

这个阶段还有一个重要工作，就是对论文格式要有个严格把关，不能存在明显格式上的问题，这是研究生初写论文存在的普遍问题。要让论文整体结构合理，格式标准，各部分都表述准确，从头到尾要像一篇认真准备的论文，而不是乱糟糟。论文格式和行文代表了治学严谨程度，也是对自己、对评审人、对读者的基本尊重。格式问题看似是小问题，往往成为学术道路上的绊脚石和拦路虎。如果能将格式、文字、图表做的尽善尽美，通常不会有个很糟糕的结局，这意味着学生即将顺利进入下一阶段实质性的学术探讨阶段了。

（5）细节上指导论文写作。等论文毛坯稿经过师徒两人多次讨论，论文整体框架已经确定，文字工作也基本完成。这时候就进入下一个阶段：细节上修改调整。这时候我通常也不直接给学生修改，而是将学生喊到办公室，和他一起读这篇论文。一句一句的读，读完了说说自己的看法，谈一下自己观点，需要做哪些进一步增删修改工作。当然，在每个段落开始的时候，要分析下段落结构是什么样的，主要承载哪些目的。这样从头到尾将论文过一遍之后，接下来就是学生要对论文段落、词句的修改和增补。

很多时候导师直接操刀，优点是效率高，速度快，缺点是将学生边缘化了，破坏了学生独立性，等论文发表后，学生不一定真切地掌握这篇论文所有工作。对我来说，一篇论文从头到尾每个字母都是学生敲进去的，这是一个很酷的事情。等学生修改完之后，师徒再从头到尾过一遍，这时候问题就不像第一遍那么多了。但往往还会有一些比较重要的修改，多是为了更好地表现研究结论，更好地便于同行阅读，让研究结论更明确、更醒目，图表更美观、简练。当然，具体多少轮的修改要视具体情况而定，逐句过这种方法经过几轮之后，论文基本上就稳定下来了，论文修改也就由此进入了下一个阶段。

（6）冷静反省提意见。论文经过多次修改后，师徒两个所思所想都已经在论文中表达了，代表了当前师徒两个人的认识。在高强度反复修改一篇论文过程中，容易形成自我强化，对一些显而易见的问题容易形成灯下黑。这时候就需要对论文进行冷却处理，冷处理半个月、一个月后，再重新阅读这篇论文，往往这时会有新认识和新发现。当然，期间通常将论文初稿送给同行，让同行看看提提意见，看看有什么明显不足，还有没有进一步提升的潜力。同行一打眼，基本上很快就能说出个一二三，这也是同行之间一种很好的学术交流方式。特别需要说明的是，这时候往往还需要取舍考量，删除冗余、不重要的部分，敝帚自珍，删除就像割自己的肉，这时候往往需要大智慧。冷静反省阶段后期，研究生要将论文打印出来，认真细致的阅读三五遍，查看错误，很多电脑屏幕上看不出来的错误，打印出来便一目了然。最后，让研究小组其他学生认真读上一两遍，多人阅读，一起挑错误，挑毛病。经过这些步骤后，这篇论文就基本上这样了。

（7）论文投稿阶段指导。冷静反省和让同行提意见阶段，也是准备投稿说明信的好时候。将论文研究背景、目的、发现和创新都写出来，遴选合适刊物准备投稿。投稿说明信很重要，如果写不好很容易在投稿初期，没有送审就被拒稿了。一定要在投稿说明信中，将论文研究内容与期刊关系说清楚，将创新和发现说明白。论文投稿过程一定要细致，不能马虎，稍有马虎便很可能带来很大的时间成本。推荐审稿人的时候一定将信息写全，最好多写几个让编辑有的选择。潜在评审人最好在参考文献中选，尤其是最近几年在主流刊物上发表研究论文的作者，且以国外学者优先。在投稿系统里面最后递交前，导师一定前前后后做好技术检查，万无一失的时候完成投稿确认。投稿后，便是或长或短的等待，如果超过三个月，可以写封信，谦逊委婉地问一下稿件评审情况。

（8）论文发表后续工作。论文经过几轮的评审与修改后，最终被刊物接收和发表了。这句话说得风淡云轻，但往往是经历扒一层的煎熬和折磨，只有经历过的人才能懂得。这时候，要让学生以这篇论文工作为基础做一个系统的PPT，在例会上给研究小组做一次学术报告，导师并给这位研究生提供一次参加学术报告的机会作为表彰。同时，将英文的论文翻译成中文，留作写学位论文之用。将论文中核心研究方法整理成一份教学材料，让研究小组每位同学都学习并掌握该方法，这样可以从整体上快速提升研究小组成员研究方法水准。

等上面工作都做完之后，导师要给学生一笔说得过去的研究生津贴补助，以表彰和祝贺他所取得的研究成绩，要有仪式感和获得感。同时，还要给学生做一下心理辅导，让他们避免骄傲自满，鼓励他们戒急戒躁。稍微修正几日后，便进入了下一个研究，下一篇论文的轮回之中。

后记：大家都是做研究，写文章的大家、高手、专家，我在这里丢丑了，呵呵。假期里面，我没事溜达到办公室，总结了一下我指导研究生写SCI论文的大致步骤，写的不好、不对的地方大家尽管留言批评。据我所知，硕士研究生大多都没体验过撰写SCI论文的感觉，我写出来帮助他们完成撰写SCI论文的心理构建，希望他们能开启美妙之旅。我撰写该博文主要是想给我的学生读一读，希望他们能有一个顺利、平安、愉悦的读研究生体验。