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Meta分析的9个快速技巧

已有 914 次阅读 2024-8-21 07:42 |个人分类:科普|系统分类:科普集锦

Meta分析的9个快速技巧

系统综述是对证据的全面综合,旨在通过系统地识别、评价和总结关于一个主题的所有相关研究来回答特定的研究问题。与传统的叙述性评价不同,系统评价遵循严格和透明的方法,以尽量减少偏见并确保其发现的可重复性。

Meta分析是一种经常用于系统综述的统计技术,用于定量地组合和分析多个个体研究的结果。它已经成为科学研究的基石方法,使学者能够综合多个研究结果,得出全面的结论,比单独的个体研究具有更大的统计能力和概括性。跨来源汇集数据,Meta分析可以揭示单个研究中可能不明显的趋势和见解,从而为累积科学、理论构建和基于证据的政策提供更可靠的基础。

虽然系统综述和Meta分析密切相关,但并非所有的系统综述都必须包括Meta分析:一些综述可能侧重于综合定性或描述性数据,而另一些综述可能在纳入的研究中没有发现足够的同质性来证明进行定量Meta分析是合理的。然而,在适当的时候,Meta分析可以通过提供现有证据的定量综合,为系统评价增加重要的价值。

Meta分析稳步兴起的同时,开放科学运动也在寻求提高科学研究的透明度、可重复性和可及性。开放科学原则提倡共享数据、材料和方法,以便其他研究人员可以更容易地验证和建立研究结果。研究表明,采用开放科学实践可以提高科学发现的可信度,并在研究界促进更大的创新和合作。尽管Meta分析和开放科学的目标之间有明显的协同作用,但整合这些实践仍然是一个挑战。因此,明确的指导方针可能有助于驾驭所涉及的复杂性。

在这里,Moreau等人通过提出开放、透明的Meta分析的9个快速技巧,弥合了Meta分析方法和开放科学原则之间的差距。这些技巧总结在图1中,旨在帮助研究人员设计、实施和发表坚持最高标准的开放和透明的Meta分析,确保他们的发现可以被科学界信任、复制和建立。作者们还提供了一份清单,以帮助研究人员、审稿人和期刊编辑在实践中实施这些指南(https://osf.io/k8aqx/)

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1 Meta分析的9个快速技巧

技巧1:定义并预注册您的协议

技巧2:选择开放的工具和软件

技巧3:使用版本控制或容器化

技巧4:以再现性为目标

技巧5:发布你的数据

技巧6:共享分析脚本

技巧7:启用无缝更新

技巧8:发布开放获取

技巧9:推广你的发现

有了这9个快速技巧,研究人员可以确保他们的Meta分析遵循开放科学原则和最佳实践,提高透明度、可重复性和可及性。这些技巧也增加了Meta分析通过批判性评估测试的可能性,并对集体知识体系做出了有意义的贡献——尽管重要的是要认识到,开放实践本身并不能保证高质量或有影响力的Meta分析。Meta分析对集体知识体系的价值和贡献还取决于方法的严谨性、纳入研究的质量以及研究问题的相关性。除了学术上的严谨,采纳这些建议也是对开放科学精神的承诺,这种精神重视信息的传播和民主化:随着Meta分析继续塑造我们对各个领域的理解,遵守这些原则将促进一个更具协作性、可访问性和创新性的研究环境,在这个环境中,知识可以不受传统障碍的束缚而蓬勃发展,所有社会成员都可以充分利用这些发现。

然而,仍有需要进一步发展和研究的领域。一个关键需求是创建更加用户友好的集成工具,这些工具可以在统一的生态系统中无缝地结合各种开放实践,从协议开发和预注册到数据提取、分析和报告。这些工具可以降低进入门槛,并促进更广泛地采用开放的Meta分析工作流。与此相关的是,需要更全面的培训资源和教育计划,使研究人员具备进行开放、可重复的Meta分析所需的技能。

此外,随着人工智能和机器学习能力的进步,必须仔细探索将它们负责任地集成到Meta分析过程中。新的基于人工智能的方法正在出现,可以彻底改变和简化Meta分析过程的各个阶段。例如,Abstrackr等工具使用自然语言处理来协助进行初步筛选文献检索结果,可能加速研究选择。基于人工智能的文本挖掘和数据提取方法,例如在RobotReviewer (https://robotreviewer.net)等工具中实现的方法,可以帮助从纳入的研究中自动化部分数据提取过程。随着这些方法的不断发展和变得更容易获得,在保持人类监督和方法严谨性的同时,制定利用它们的最佳实践和指导方针,对于在不损害科学完整性的情况下利用它们的潜在效率收益至关重要。

更普遍的是,需要持续的研究来评估开放Meta分析对科学进步、循证决策和公众对研究信任的现实影响。对这些实践的采用率、挑战和切实利益的实证调查可以为进一步的改进提供信息,并在研究界内外推动更广泛的接受。

参考文献

[1] Moreau D, Wiebels K. Nine quick tips for open meta-analyses. PLoS Comput Biol. 2024 Jul 25;20(7):e1012252. doi: 10.1371/journal.pcbi.1012252.

以往推荐如下:

1. 分子生物标志物数据库MarkerDB

2. 细胞标志物数据库CellMarker 2.0

3. 细胞发育轨迹数据库CellTracer

4. 人类细胞互作数据库:CITEdb

5. EMT标记物数据库:EMTome

6. EMT基因数据库:dbEMT

7. EMT基因调控数据库:EMTRegulome

8. RNA与疾病关系数据库:RNADisease v4.0

9. RNA修饰关联的读出、擦除、写入蛋白靶标数据库:RM2Target

10. 非编码RNA与免疫关系数据库:RNA2Immune

11. 值得关注的宝藏数据库:CNCB-NGDC

12. 免疫信号通路关联的调控子数据库:ImmReg

13. 利用药物转录组图谱探索中药药理活性成分平台:ITCM

14. AgeAnno:人类衰老单细胞注释知识库

15. 细菌必需非编码RNA资源:DBEncRNA

16. 细胞标志物数据库:singleCellBase

17. 实验验证型人类miRNA-mRNA互作数据库综述

18. 肿瘤免疫治疗基因表达资源:TIGER

19. 基因组、药物基因组和免疫基因组水平基因集癌症分析平台:GSCA

20. 首个全面的耐药性信息景观:DRESIS

21. 生物信息资源平台:bio.tools

22. 研究资源识别门户:RRID

23. 包含细胞上下文信息的细胞互作数据库:CCIDB

24. HMDD 4.0miRNA-疾病实验验证关系数据库

25. LncRNADisease v3.0lncRNA-疾病关系数据库更新版

26. ncRNADrug:与耐药和药物靶向相关的实验验证和预测ncRNA

27. CellSTAR:单细胞转录基因组注释的综合资源

28. RMBase v3.0RNA修饰的景观、机制和功能

29. CancerProteome:破译癌症中蛋白质组景观资源

30. CROST:空间转录组综合数据库

 

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