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因果推理第一课

已有 1514 次阅读 2023-6-23 11:31 |个人分类:科普|系统分类:科普集锦

因果推理第一课 

维基百科:因果推断是在一个较大系统内部确定指定现象的实际、独立效果的过程。因果推断和相关性推断的主要区别是前者分析结果变量在其原因变量变化时发生的回应。研究事物起因的科学则称作原因论。因果推断可给出因果关系推理建立的因果关系模型的证据。目前,因果推断在所有科学中都得到了广泛研究。(引自https://zh.wikipedia.org/zh-cn/因果推断) 

关于因果推断的入门书籍,本次推荐的《因果推理第一课》(A First Course in Causal Inference)是加州大学伯克利分校Peng Ding教授“因果推理”课程的课堂讲稿。Peng Ding教授根据过去七年在加州大学伯克利分校的“因果推理”课程撰写了这篇课堂讲稿。由于一半的学生是本科生,所以该因果推理入门书籍只需要概率论、统计推理、线性和逻辑回归的基本知识。 

全书在arXiv预印本(图1https://arxiv.org/abs/2305.18793)可以获取,总共分有六部分,共29个章节。

image.png 

1 A First Course in Causal Inference》预印本

 

可以根据以下六部分内容有挑选的进行入门:

第一部分:简介

第二部分:随机试验

第三部分:观察研究

第四部分:观察研究面临的困难和挑战

第五部分:辅助变量

第六部分:后治疗变量的因果机制

 

参考文献

[1] Ding P. A First Course in Causal Inference. arXiv preprint arXiv:2305.18793, 2023.

 

以往推荐如下:

1. 分子生物标志物数据库MarkerDB

2. 细胞标志物数据库CellMarker 2.0

3. 细胞发育轨迹数据库CellTracer

4. 人类细胞互作数据库:CITEdb

5. EMT标记物数据库:EMTome

6. EMT基因数据库:dbEMT

7. EMT基因调控数据库:EMTRegulome

8. RNA与疾病关系数据库:RNADisease v4.0

9. RNA修饰关联的读出、擦除、写入蛋白靶标数据库:RM2Target

10. 非编码RNA与免疫关系数据库:RNA2Immune

11. 值得关注的宝藏数据库:CNCB-NGDC

12. 免疫信号通路关联的调控子数据库:ImmReg

13. 利用药物转录组图谱探索中药药理活性成分平台:ITCM

14. AgeAnno:人类衰老单细胞注释知识库

15. 细菌必需非编码RNA资源:DBEncRNA

16. 细胞标志物数据库:singleCellBase

17. 实验验证型人类miRNA-mRNA互作数据库综述

 

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