免疫信号通路关联的调控子数据库：ImmReg

免疫系统失调已被发现是癌症发展的主要原因。免疫治疗已经成为一种有前途的癌症治疗策略。免疫相关基因表达失调的基础知识对于产生强大的免疫至关重要，并为癌症免疫治疗提供了新的见解。许多机制有助于基因表达调控，并确保转录对外部信号的响应。通过定量和计算分析，在识别基因表达的调控因子方面获得了重要的新见解。转录因子(Transcription Factors, TFs)是基因表达的关键调控因子，多种转录因子已被证实在免疫调节中发挥关键作用。例如，HIF和缺氧途径可以控制先天免疫和适应性免疫。TF的IRF家族在免疫应答和肿瘤发生中的功能作用越来越明确。此外，STAT3在肿瘤炎症和免疫中具有双重作用，是一种很有前途的癌症治疗靶点。

 除了TF，基因表达还被其他调控因子调控，如microRNAs (miRNAs)、RNA结合蛋白(RBPs)和长链非编码RNA (lncRNAs)。miRNA通过负调控关键免疫相关基因的表达起作用，从而为调控电路贡献了重要的逻辑元件，如miRNA-17-92簇。此外，一些RBPs和lncRNA也被发现在免疫系统中发挥着基础作用。例如，RNA结合蛋白ZAP既可以作为直接抗病毒限制因子，也可以作为干扰素分解因子。最近的一项研究揭示了YTHDF3通过FOXO3 mRNA的翻译，作为抗病毒免疫的负调控因子。此外，lncRNAs NeST, NRON和LINK-A也被发现是对免疫反应调节至关重要。目前，全面的免疫相关途径的免疫调控因子仍然缺乏。

 为了填补这一空白，有必要的系统地识别33种癌症类型中免疫相关途径的潜在调控(包括TF、miRNAs、RBP和lncRNAs)。免疫调控因子可能在免疫细胞群中高表达，在癌症中表达紊乱，并与癌症中的免疫细胞浸润相关。这些免疫调节有助于识别癌症相关基因，并进一步识别具有不同临床特征的癌症亚型。全面了解免疫相关通路的潜在调控机制是理解肿瘤微环境下调控网络结构的重要前提。

 基于此，一个用户友好的资源ImmReg (图1，http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/ImmReg/)被开发。它具有多个模块，可以可视化、浏览和下载免疫调控（图2）。ImmReg提供了一个全面的免疫学规律，将为基于RNA癌症免疫疗法的未来发展提供线索。

图1 ImmReg主页

图2 ImmReg网络资源概述

越来越多的免疫调控在癌症中被发现。然而，只有少数候选因子被研究。值得注意的是，在每种癌症类型中，都有数百种潜在的调节免疫相关途径的规则。此外，免疫相关的调控因子在癌症中可能出现表达扰动，在免疫细胞中表达较高，且其表达水平与免疫细胞浸润显著相关。这些观察结果有助于全面了解癌症调控的潜在免疫学作用。

 综上所述，ImmReg强调了TF、miRNAs、RBPs和lncRNA在免疫调节中的功能和调节作用，对于了解免疫调控在肿瘤中的作用具有重要意义。潜在调控的鉴定为免疫治疗提供了第一步，深入免疫学规律将极大地促进癌症机制理解和更好的免疫疗法。 

参考文献

[1] Jiang T, Zhou W, Chang Z, et al. ImmReg: the regulon atlas of immune-related pathways across cancer types. Nucleic Acids Res. 2021;49(21):12106-12118. doi:10.1093/nar/gkab1041

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