非编码RNA与免疫关系数据库：RNA2Immune

 非编码RNAs(ncRNAs)，如microRNAs (miRNAs)、长链非编码RNAs (lncRNAs)和环状RNAs (circRNAs)，已成为免疫系统的重要调节因子，参与控制免疫细胞生物学、疾病发病机制以及疫苗反应。ncRNA-免疫关联数据库将促进我们对免疫系统中ncRNA依赖机制的理解，并推动免疫疾病治疗和预防的发展。这次，介绍一个全面的数据库：RNA2Immune（图1，http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/rna2immune/home.jsp）。RNA2Immune旨在提供一个高质量的实验支持数据库资源，将ncRNA调节机制与免疫细胞功能、免疫疾病、癌症免疫和疫苗联系起来。当前版本，RNA2Immune记录了42个宿主物种中的50,433个免疫-ncRNA关联条目，包括:(1) 6690个涉及31种免疫细胞类型的免疫功能ncRNA关联条目，(2) 38,672个ncRNA与348种免疫疾病关联条目，(3) 4833个ncRNA与癌症免疫关联条目，(4)与针对22种疾病的26种疫苗反应的238个ncRNA关联条目。RNA2Immune提供了一个用户友好的界面，用于浏览、搜索和下载ncRNA-免疫系统关联条目。总的来说，RNA2Immune提供了关于ncRNA如何影响免疫细胞功能、这些ncRNA的失调如何导致病理后果(免疫疾病和癌症)以及ncRNA如何影响对疫苗的免疫反应的重要信息。 

图1 RNA2Immune主页 

RNA2Immune收集了四部分经实验验证的数据集，包括与免疫细胞功能、免疫疾病、癌症免疫和疫苗相关的ncRNAs。所有数据都得到了实验证据的支持，如RNA下拉试验、RNA干扰(RNAi)、定量实时聚合酶链式反应(qRT-PCR)和荧光素酶报告试验。在数据收集过程中采用了三个步骤:i)收集基本信息，ii)从PubMed数据库中搜索相关文章，iii)由至少两名研究人员从所选文章中提取相关信息。该资源的一般工作流和特性如图2所示。

图2 RNA2Immune包含的四种ncRNA参与的免疫调控类型、用户界面内容 

参考文献

[1] Wang J, Li S, Wang T, et al. RNA2Immune: A database of experimentally supported data linking non-coding RNA regulation to the immune system. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2022; doi:10.1016/j.gpb.2022.05.001

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