||
miRNA组学
微小RNA(microRNA,简称miRNA)是非编码RNA研究领域的明星分子,它能够调控基因表达水平并且直接参与细胞稳态。miRNA的误调节能够导致疾病的发生,因而使其成为有趣的小分子生物标志物。另一方面,通过添加/上调细胞miRNA,模拟miRNA合成物或使用miRNA诱饵下调其功能,miRNA可以成为治疗靶点。具体地,miRNA的基本概念和功能可参见往期文章:miRNA是何方神圣?和miRNA也走非主流路线!
由于miRNA的流行程度和小分子大功能,专门为其著书立说的书籍也有好几本。例如Kenneth Tew主编的《miRNA and Cancer》(https://www.elsevier.com/books/mirna-and-cancer/tew/978-0-12-811922-8)、Stefan de Folter主编的《Plant MicroRNAs》(https://link.springer.com/book/10.1007/978-1-4939-9042-9)、Krishnarao Appasani主编的《MicroRNAs: From Basic Science to Disease Biology》(https://www.cambridge.org/core/books/micrornas/E7B201D0C65B9A94B30F54D0ECB39BD0)和Massimo Negrini等主编的《MicroRNA in Human Malignancies》(https://www.elsevier.com/books/microrna-in-human-malignancies/negrini/978-0-12-822287-4)等。以上大部分书籍都将miRNA与疾病联系起来,探究miRNA的生物学功能。
2014年,Jens Allmer和Malik Yousef将miRNA相关研究定义为miRNomics(姑且译为miRNA组学),并且出了书籍《miRNomics》第一版。时隔7年之后,2022年《miRNomics》第二版问世(图1,https://link.springer.com/book/10.1007/978-1-0716-1170-8)。相比前一版,内容更加丰富了,尤其是添加了miRNA海绵内容。
图1 《miRNomics》书籍第二版
整本书分为三部分(共19章),第一部分主要介绍miRNA相关的分子生物学机理以及实验手段,第二部分从计算方法学角度研究miRNA,第三部分讲述miRNA调控与压力和疾病间的关系以及讨论miRNA作为生物标志物和靶标治疗的潜力。
全书内容还是丰富的,从miRNA调控机理、miRNA实验检测方法、miRNA功能注释与验证、miRNA数据库与工具、miRNA以及靶标识别、miRNA与疾病关系到miRNA参与细胞通讯等内容,最后一章还重点说明了miRNA研究领域当今存在的44个挑战,详细目录内容见图2。
图2 《miRNomics》目录
后话
miRNA书籍对于走进miRNA领域是一种捷径,甚至比从大量研究文献中了解miRNA研究方向还要直接。当然,miRNA书籍的挑选还要看自己所要关心的研究对象。总体来说,《miRNomics》书籍是一本比较全面的书籍,值得选择性或全部阅读。
参考文献与链接
[1] Yousef, M., & Allmer, J. (Eds.). (2022). miRNomics: microRNA biology and computational analysis. Totowa, NJ: Humana Press.
以往推荐如下:
1. 因果推理综述推荐一篇
2. 生物学家的机器学习指南
3. 基础模型的机遇与风险
4. 一份单细胞数据分析教程
8. 国外知乎:Quora
11. 预印本知多少?
14. mRNA表达无法取代蛋白质表达
15. scIB:单细胞数据融合基准框架
16. 临床医疗维修店铺
18. 怎样做好一项研究?
19. 怎样做开题报告?
20. 深度学习助力单细胞数据分析
21. Any RNA
22. 走进数据科学
23. 直抵自闭症核心
24. 癌症内RNA
25. 一对搭档:计算与生物
26. TF靶标
27. 生物组织内细胞通讯
28. 记一次主题编辑经历
29. 6个,10个,14个......
30. 你健康吗?
31. 你衰老了吗?
32. scIMC:填充单细胞转录组数据缺失值
34. 多组学的基本要素
35. 怎样开展网络数据分析?
Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )
GMT+8, 2024-11-22 17:55
Powered by ScienceNet.cn
Copyright © 2007- 中国科学报社