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基因表达涉及转录、翻译以及蛋白质和mRNA之间的转换率,其通路将基因型与表型有效的连接起来(图1)。蛋白质丰度多大程度取决于mRNA表达以及mRNA与蛋白质是否存在相关性,仍然是一个具有争议性的话题。由于mRNA与蛋白质的符号(symbol)名称一样,为了省事,许多研究者用mRNA表达近似取代蛋白质表达。事实上,mRNA表达无法取代蛋白质表达(图2)。
图1 基因表达通路概况
图2 基因表达调控中的mRNAs、蛋白质和新机理
通过构建基因表达调控定量参数模型(图3),蛋白质和mRNAs表达水平涉及众多因素,蛋白质与mRNAs之间的关系并不呈现简单的线性关系。通常情况,虽然蛋白质和mRNAs表达水平呈现合理的相关性(例如借助基因表达调控定量参数、上下文混杂因子和缓冲机理),但是蛋白质组学和转录组学在机体内共同提供有用的非冗余读数(readouts)。因此,整合两种数据类型(蛋白质组学和转录组)将有助于深入理解基因表达调控的机理。
图3 基因表达调控的定量参数
后话
mRNA与蛋白质表达彼此之间无可替代,虽然存在相关性,彼此之间也要经过复杂的转换。所以机体内不存在冗余的信息,如果存在,那一定是我们还没有深入了解。
参考文献:
[1] Buccitelli C, Selbach M. mRNAs, proteins and the emerging principles of gene expression control. Nat Rev Genet. 2020;21(10):630-644. doi:10.1038/s41576-020-0258-4
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