写在前面

DIANA的中文译为黛安娜，源于希腊神话中的月亮女神狄安娜。由于寓意很好，许多人以DIANA为名，例如，英国威尔士黛安娜王妃，美国R&B歌手戴安娜罗斯。甚至在miRNA方面，也有个DIANA系列。

01

—

DIANA系列

DIANA系列针对miRNA开发了一系列分析工具（图1），包括microCLIP、TarBase、microT-CDS、MirPath、LncBase、MR-microT、mirPub、miRGen和MirExTra。如图2，这些工具主要涉及miRNA靶标预测、实验验证型miRNA靶标数据收集和miRNA富集分析和功能注释等。

图1 DIANA系列主页

图2 DIANA系列工具一览

02

—

DIANA系列之主业

miRNA靶标是DIANA系列的主业，总共有5款工具干这个事情，包括microCLIP、TarBase、microT-CDS、LncBase和MR-microT。其中，microCLIP、microT-CDS和MR-microT为miRNA靶标预测工具，TarBase为流行的实验验证型miRNA靶标数据库，LncBase为miRNA-lncRNA互作数据库（包括计算机预测性和实验验证型两种类型数据）。

03

—

DIANA系列之副业

DIANA系列的副业有miRNA信号通路富集分析（MirPath）、miRNA相关文献检索（mirPub）、miRNA启动子和调控子预测（miRGen）、miRNA与转录因子结合分析（MirExTra）。当然，还提供一套流水线作业平台（Taverna，图3）。

图3 Taverna平台

后话

DIANA系列做miRNA相关工具已超过15年，可见对miRNA的专注程度。从目前看，DIANA系列考虑了miRNA与mRNA、TF和lncRNA之间的关系，不知道未来是否会融入miRNA与其他RNA（例如circRNA和piRNA）之间的关系。

参考链接：

[1] http://diana.imis.athena-innovation.gr/DianaTools/

[2] http://www.taverna.org.uk/download/workbench/2-5/

更多背景知识如下：

1. ​miRNA是何方神圣？

2. ​What？植物miRNA能够调控动物靶基因？

3. miRNA也走非主流路线！

4. Tools4miRs：只为miRNA分析

5. miRNA序列与表达谱数据库

号外，ceRNA可是miRNA介导的哦。为了便于交流，我们为miRNA介导的ceRNA研究在Frontiers in Molecular Biosciences杂志（ 2020_IF = 5.246）整了个专刊，主题为“Computational Identification of ceRNA Regulation”。投稿链接：https://www.frontiersin.org/research-topics/24340/。