写在前面

全面收集已有数据库是一个辛苦活，因为需要不停的关注数据库开发动态。这里，miRNA数据库也不例外。今天就推荐一个专门收集miRNA数据库的网站Tools4miRs（https://tools4mirs.org/）。可以为大家省下不少miRNA研究时间。

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Tools4miRs

2016年，在Bioinformatics杂志中发表了一篇标题为《Tools4miRs – one place to gather all the tools for miRNA analysis》短文（如图1）。Tools4miRs不仅收集miRNA相关的数据库，而且还收集miRNA相关的工具。

图1 Tools4miRs论文

目前，Tools4miRs收集了68个数据库，超过170个工具（如图2）。

图2 Tools4miRs网站

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后话

Tools4miRs提供了miRNA相关的数据库和软件的名称、描述、适合物种、输入数据和参考文献等信息，方便查阅。另外，呈现的数据库和软件都是最新版本。特别地，软件按照实现的功能还被分为七大类。例如你想做miRNA靶标预测，只需要关注类别“Target Prediction”的60个工具即可。多的不说了，自行挖掘才能感受。

参考文献：

[1] Lukasik A, Wójcikowski M, Zielenkiewicz P. Tools4miRs - one place to gather all the tools for miRNA analysis. Bioinformatics. 2016 Sep 1;32(17):2722-4.

更多背景知识如下：

1. ​miRNA是何方神圣？

2. ​What？植物miRNA能够调控动物靶基因？

3. miRNA也走非主流路线！

号外，ceRNA可是miRNA介导的哦。为了便于交流，我们为miRNA介导的ceRNA研究在Frontiers in Molecular Biosciences杂志（ 2020_IF = 5.246）整了个专刊，主题为“Computational Identification of ceRNA Regulation”。投稿链接：https://www.frontiersin.org/research-topics/24340/。