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[转载]什么?ceRNA竞争除了“单挑”模式,还可能有“组队”模式?

已有 1761 次阅读 2021-7-29 11:01 |个人分类:科普|系统分类:科普集锦|文章来源:转载

写在前面

在生物学、社会学、经济学等许多领域,竞争无处不在。为了达到某一共同目标,竞争在不同实体间产生了,这些实体包括生物个体、社会团体和经济团体等。一般而言,根据竞争实体的单位划分,主要有两种竞争类型:个体竞争和群体竞争。个体竞争发生在不同个体之间,而群体竞争发生在不同群体或团体之间。


类似地,ceRNA竞争也存在个体竞争(单个ceRNA分子与单个mRNA之间的竞争)和群体竞争(ceRNA簇与mRNA簇之间的竞争)两种类型。为了更加形象的说明,本文将个体竞争视为“单挑”模式,群体竞争视为“组队”模式。那么,ceRNA竞争的“单挑”模式和“组队”模式究竟怎么回事?就是今天要分享的内容。


1. “单挑”模式

如图1所示,ceRNA与靶基因mRNA之间以“one vs. one单挑模式进行竞争。单挑成功后,mRNA将会被释放,翻译成蛋白质。否则,mRNA将会被降解。ceRNA竞争的单挑模式结果是编织成ceRNA网络。


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图1 ceRNA或miRNA海绵个体竞争示意图


2. “组队”模式

有时候,单个ceRNA没有足够的竞争力挑战单个靶基因mRNA。此时,单个ceRNA通过寻求其他志同道合的小伙伴来参与竞争。当然,靶基因mRNA也寻求其他志同道合的小伙伴迎接挑战。如图2所示,ceRNAmRNA之间以“group vs. group组队模式进行竞争。组队成功后,多个mRNA将会被释放,翻译成蛋白质。否则,多个mRNA将会被降解。ceRNA竞争的组队模式结果是凝聚成ceRNA模块


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图2 ceRNA或miRNA海绵群体竞争示意图


目前,ceRNA竞争的“单挑”模式已被生物学实验所证实,ceRNA竞争的“组队”模式仍需进一步生物学证实。但是ceRNA竞争的“组队”模式是合理的,因为团体竞争模式不仅仅是人类社会进步的驱动力,同时也是种群生存与进化的本能。


参考文献:

[1] Salmena, L., Poliseno, L., Tay, Y., Kats, L.,& Pandolfi, P. P. (2011). A ceRNA hypothesis: The Rosetta Stone of a hidden RNA language? Cell146(3), 353–358. https://doi.org/10.1016/j.cell.2011.07.014.

[2] Le, T. D., Zhang, J., Liu, L., & Li, J.(2017). Computational methods for identifying miRNA sponge interactions. Briefings in Bioinformatics18(4), 577–590.https://doi.org/10.1093/bib/bbw042.

[3] Zhang, J., Xu, T., Liu, L., Zhang, W., Zhao, C.,Li, S., Li, J., Rao, N., & Le, T. D. (2020). LMSM: a modular approachfor identifying lncRNA related miRNA sponge modules in breast cancer. PLoS Computational Biology16(4), e1007851.https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007851.


更多背景知识如下:

1. ceRNA!你是谁?为了谁?

2. ceRNA漫画,看吗?


号外:

我们为ceRNA家族在Frontiers in Molecular Biosciences杂志( 2020_IF = 5.246)整了个专刊,主题为“Computational Identification of ceRNA Regulation”。投稿链接:https://www.frontiersin.org/research-topics/24340/


更多详细情况请关注微信公众号BMELabDU。

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