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ImageJ软件使用方法:PEEM/LEEM

已有 32576 次阅读 2017-11-27 23:55 |个人分类:图形化处理|系统分类:科研笔记

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1) ImageJ软件使用方法

2)PEEM/LEEM操作




http://www.mogoedit.com/tool/info/c_id/485/type/2



https://jingyan.baidu.com/article/5552ef47e4d98c518efbc963.html



摘录:果多网

    利用Image J 测量某一相的面积分数,通常要求各相之间颜色有一定的反差才行


第一步:打开要处理的图片,将图片拖入Image J窗口就能打开。

第二步:按照Image → Color → Split Channels顺序将RGB图像处理成灰度图,或者按照Image → Type → 8-bit顺序将图片设置成8进位制图片,二者效果一样。


第三步:设置标尺(要得到某相的具体尺寸或面积值需要此步骤,只求某相的面积分数忽略第三步),方法是利用直线工具画一条已知距离的线(例如画在标尺上),然后Analyze → Set Scale→'Known Distance' 输入实际尺寸(如3000 um)→'Unit of Measurement'输入毫米(如um)→'Global'打勾(为什么要打勾?)ok


第四步:按照Process → Binary → Make Binary数序图像处理成黑白色的。

第五步:按照Image → Adjust → Threshold顺序将图片黑色部分处理成红色。


第六步:点击Analyze → Set Measurements,在弹出对话框设置你想要输出的内容。


第七步:测量面积和面积分数,方法是Analyze → Measur,弹出的对话框就给出了结果。

选定每一个粒子怎么选?能不能自动选择一个腐蚀点区域?

第八步:如果要测量每个相或粒子的面积,Analyze → Analyze Particles,在弹出对话框点选相应部分就可以了。


下面的图是上图中心部位的局部放大,可以看出每个要测量的红色区域都已经标号,方便从结果表格中找到它。






工具栏从左至右的4种分别是:区域选择工具 ,直线选择工具,角度工具,点工具。

Image J软件操作与应用前攻略














http://www.dxy.cn/bbs/thread/34750404#34750404


mageJ(官网:imagej.nih.gov/ij/)是一个基于java的公共的图像处理软件,它是由National Institutes of Health(NIH)开发的一款功能强大的免费软件,在生物医学图像分析中起着非常重要的作用。

ImageJ能够显示,编辑,分析,处理,保存,打印8位,16位,32位的图片, 支持TIFF(默认的文件格式,无损压缩格式), PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等多种格式。

Imagej 的高级功能均依靠插件来实现,Imagej插件下载地址。大家可以根据自己的需要进行相关下载。网上有关Imagej的教程和操作方法有很多,有兴趣的朋友可以自行学习。

对于Imagej的使用方法,网上各种论坛有许多有用的经验。也有各种教程可以供大家学习。孙水发和董方敏的这本书能够帮助我们对imagej和图像分析有一个基本的了解。



魔棒:魔棒工具和photoshop里的类似,可以自动发现目标的边界并勾勒出形状。当图像明暗对比明显时尤为有用。有时可配合阈值(Thresholding)使用。

【必须双击魔棒工具,设置tolerance,如等于20,才能合理地选择并勾勒出目标点形状;目标点形状勾勒出后,摁字母m,则在弹出的Results窗口中,自动给出目标区域的面积、周长等数值;换一个目标点,重复上述操作,results中u会将不同目标区域的数值自动追加在后面,形成数据列表】



魔棒:

魔棒工具和

photoshop

里的类似,可以自动发现目标的边界并勾勒出形状。当图像

明暗对比明显时尤为有用。有时可配合阈值

(Thresholding)

使用。






https://blog.sciencenet.cn/blog-567091-1087158.html

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