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253.既往新型冠状病毒感染对奥米克隆BA.4和BA.5亚变异体的保护作用

已有 1833 次阅读 2022-10-21 18:50 |个人分类:新冠疫苗|系统分类:科普集锦


既往新型冠状病毒感染对奥米克隆BA.4和BA.5亚变异体的保护作用

严重急性呼吸综合征冠状病毒2(新型冠状病毒)B.1.1.529 (omicron)变异体的BA.4和BA.5亚变异体已显示出逃避中和抗体的能力。1到2022年5月初,这些子变异体在卡塔尔有了可观的存在(图2010年S1)补充附录,可在NEJM.org获得这封信的全文)并在6月8日成为主要的子变体(图S2)。我们采用试验阴性的病例对照研究设计,评估了既往新型冠状病毒感染在预防BA.4和BA.5亚变异体再感染方面的有效性(S1章节)。2

我们从国家新型冠状病毒数据库中提取了有关新型冠状病毒实验室检测、临床感染、疫苗接种和人口统计学细节的数据,其中包括在卡塔尔医疗保健机构进行的聚合酶链反应(PCR)和快速抗原检测的所有结果。既往感染被定义为在新的阳性检测结果出现之前至少90天的阳性检测结果;阴性结果的人用作对照。2为了控制卡塔尔新型冠状病毒感染风险的差异,我们根据性别、10岁年龄组、国籍、并存疾病数量、检测日历周、检测方法和检测原因对病例和对照组进行了匹配。2根据2021年12月19日奥米克隆浪潮开始前(奥米克隆前感染)或该日期后(奥米克隆后感染)在卡塔尔的发生情况,进一步对以前的感染进行分类。3

在主要分析中,我们在2022年5月7日至7月28日之间的PCR测试中使用S基因靶失败(SGTF)的测定来估计先前感染对抗BA.4或BA.5再感染的有效性(图S3)。SGTF命名表明S基因中密码子69和70的缺失,这在omicron亚变异体BA.1、BA.4和BA.5中是常见的。因为BA.1在研究中的发生率可以忽略不计,如测序所证实的(S2部分),SGTF被用作BA.4或BA.5感染的替代标记。在研究过程中,以SGTF为特征的其他变异的发生率可以忽略不计。我们还在假设2022年6月8日至7月28日期间所有诊断的新型冠状病毒感染都是BA.4或BA.5感染的基础上评估了有效性,因为这些是这一时期的主要亚变异体。关于研究人群的详细情况见图S3和S4。研究人群的基线特征见表S1。研究人群在很大程度上代表了卡塔尔人口(表S2)。

1。既往新型冠状病毒感染在预防Omicron BA.4和BA.5亚变异体再感染中的有效性。*

分析类型

案例

控制

既往感染的有效性(95%可信区间)


前一次感染后的天数

既往感染

没有以前的感染

前一次感染后的天数

既往感染

没有以前的感染



中位数

病人数量

中位数

病人数量

%

SGTF状态代表BA.4或BA.5感染








对有症状的BA.4或BA.5感染的有效性








先前感染

518

63

549

489

265

1,763

35.5 (12.1–52.7)

既往感染

189

49

549

181

477

1,763

76.2 (66.4–83.1)

对任何BA.4或BA.5感染的有效性








先前感染

490

484

4,234

482

2,139

14,466

27.7 (19.3–35.2)

既往感染

181

294

4,234

179

4,131

14,466

78.0 (75.0–80.7)

BA.4和BA.5占优势期间的任何感染§








对有症状的BA.4或BA.5感染的有效性








先前感染

496

244

2,509

490

1,089

7,634

38.1 (27.7–46.9)

既往感染

184

134

2,509

175

2,086

7,634

84.5 (81.1–87.2)

对任何BA.4或BA.5感染的有效性








先前感染

493

1417

14,060

490

7,139

49,063

33.5 (29.3–37.5)

既往感染

182

855

14,060

177

13,421

49,063

80.2 (78.7–81.7)

* 根据性别、10岁年龄组、国籍、并存疾病数量、检测日历周、检测方法(聚合酶链反应或快速抗原)和检测原因,将病例和对照组进行1比5的匹配。附录中的表S3和S4提供了敏感性分析的结果。新型冠状病毒表示严重急性呼吸综合征冠状病毒2。

† 使用试验阴性的病例对照研究设计来评估既往感染预防再感染的有效性。置信区间(CI)未针对多重性进行调整,因此不应用于推断组间的明确差异。

‡ 在2022年5月7日至7月28日之间诊断出表明S基因靶向失败(SGTF)的感染。

§ 这一类别包括2022年6月8日至7月28日期间诊断的所有新型冠状病毒感染,当时BA.4和BA.5亚变异体占主导地位。更大的病例数意味着这种估计的统计精度提高了;然而,该估计值仅提供了有效性的上限,因为在此期间发生的一些感染是由BA.2亚变异体引起的,与BA.4或BA.5相比,ba . 2亚变异体与更少的免疫系统逃避有关。(BA.1亚变异体在研究期间不再在人群中传播。)

 

表1。既往新型冠状病毒感染在预防Omicron BA.4和BA.5亚变异体再感染中的有效性。

前感染对有症状的BA.4或BA.5再感染的有效性为35.5% (95%可信区间[CI],12.1至52.7);无论是否存在症状,对BA.4或BA.5再感染的有效性为27.7% (95% CI,19.3至35.2)(表1).克隆后感染对有症状的BA.4或BA.5再感染的有效性为76.2% (95% CI,66.4至83.1);对任何BA.4或BA.5再感染的有效性为78.0% (95% CI为75.0至80.7)。

在先前感染的有效性分析中,我们假设所有诊断的感染都是BA.4或BA.5,我们发现结果与主要分析的结果相似。根据自前次感染以来的时间间隔对有效性进行分层分析,结果显示随着时间的推移保护作用逐渐减弱(S3部分和S3表)。在调整疫苗接种状态和根据疫苗剂量数进行匹配后进行的敏感性分析证实了主要分析的结果(表S3和S4)。根据疫苗接种状况分类的分析也证实了研究结果,但表明疫苗接种者的有效性可能略高。研究设计的局限性在S1部分讨论。

当先前的新型冠状病毒感染是由克隆前变异体引起时,对先前的BA.4或BA.5再感染的保护是适度的,但当它是由克隆后亚变异体(包括BA.1或BA.2)引起时,保护是强的。BA.4或BA.5亚变异体对既往感染的保护作用低于BA.1或BA.2亚变异体对再感染的保护作用3-5因为随着时间的推移,免疫保护作用越来越弱,BA.4和BA.5亚变异体的免疫系统逃避能力更强。

原文链接:Altarawneh HN, Chemaitelly H, Ayoub HH, Hasan MR, Coyle P, Yassine HM, Al-Khatib HA, Smatti MK, Al-Kanaani Z, Al-Kuwari E, Jeremijenko A, Kaleeckal AH, Latif AN, Shaik RM, Abdul-Rahim HF, Nasrallah GK, Al-Kuwari MG, Butt AA, Al-Romaihi HE, Al-Thani MH, Al-Khal A, Bertollini R, Tang P, Abu-Raddad LJ. Protective Effect of Previous SARS-CoV-2 Infection against Omicron BA.4 and BA.5 Subvariants. N Engl J Med. 2022 Oct 5. doi: 10.1056/NEJMc2209306. Epub ahead of print. PMID: 36198139.




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