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Expansionand functional divergence of JmjC-containing histone demethylases: significance of duplications in ancestral angiospermsand vertebrates
One-sentencesummaries:
Duplicationand sequence divergence of a gene family for histone demethylases likely contributedto the enhancement of chromatin-based regulation inangiospermsand vertebrates
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26059336
JmjC是去甲基化酶,组蛋白去甲基化,重要的表观遗传因子。现在在哈佛的yi zhang
(http://zhanglab.tch.harvard.edu/) 做了很多工作。 去甲基化还有一类基因,有名的是LSD,这个是第一个发现的去甲基化酶,是施杨首先发现的。
我们做了一些分析工作。主要发现其在被子植物早期保留较多,反而在近期的核心真双子叶和十字花科里保留较少。按先前的分析,大部分重复基因主要是近期基因组重复保留下来的。
动物中主要是脊椎动物早期,有意思Y染色体上有两个JMJC基因,相当于Y染色体形成增加了两个jmjC基因。在脊椎动物中,好几个分支上有3~4个成员,在SET(组蛋白赖氨酸甲基化酶)这样例子很少。有几个成员是哺乳动物特有的。
我们与甲基化酶SET蛋白(我们在2012年发表了两篇SET基因家族分析工作),以及精氨酸甲基化酶PRMT做了比较分析。
http://www.plantphysiol.org/content/early/2015/06/09/pp.15.00520.abstract
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