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JmjC基因家族工作在Plant Physiology上发表

已有 5883 次阅读 2015-6-12 00:12 |系统分类:论文交流| plant, Physiology, 基因家族, jmjc

Expansionand functional divergence of JmjC-containing histone demethylases: significance of duplications in ancestral angiospermsand vertebrates

One-sentencesummaries:

Duplicationand sequence divergence of a gene family for histone demethylases likely contributedto the enhancement of chromatin-based regulation inangiospermsand vertebrates

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26059336

JmjC是去甲基化酶，组蛋白去甲基化，重要的表观遗传因子。现在在哈佛的yi zhang

（http://zhanglab.tch.harvard.edu/）做了很多工作。去甲基化还有一类基因，有名的是LSD，这个是第一个发现的去甲基化酶，是施杨首先发现的。

我们做了一些分析工作。主要发现其在被子植物早期保留较多，反而在近期的核心真双子叶和十字花科里保留较少。按先前的分析，大部分重复基因主要是近期基因组重复保留下来的。

动物中主要是脊椎动物早期，有意思Y染色体上有两个JMJC基因，相当于Y染色体形成增加了两个jmjC基因。在脊椎动物中，好几个分支上有3~4个成员，在SET（组蛋白赖氨酸甲基化酶）这样例子很少。有几个成员是哺乳动物特有的。

我们与甲基化酶SET蛋白（我们在2012年发表了两篇SET基因家族分析工作），以及精氨酸甲基化酶PRMT做了比较分析。