||
Clin Infect Dis:H7N9核内基因多起源或发生多次重配
摘要:H7N9的核内基因多起源或者发生了重配。根据核内基因的不用lineages,可以把现有的H7N9分成9个不同的基因型(genotypes)。
H7N9有8个基因,分别是HA,NA,M,PA,NP,NS,PB1,PB2,其中HA和NA是膜蛋白,而另外6个位于核内,称为核内基因。
H7N9发生以来,很多H7N9株被测序,有必要研究其发生发展过程。根据5月23号EpiFlu数据库中的26株H7N9基因组序列构建系统进化树,除了NS形成一个单系群,其它5个核内基因有两个分支(lineages)或多个分支,表明它们多起源或者发生了重配。其中M,PA,PB1和PB2基因分别有分支与A/brambling/Beijing/16/2012聚集在一起。
M基因,之前研究显示H7N9只形成一个分支,不与brambling聚集在一起。我们的进化树显示M基因有两个分支(minor lineage 和major lineage ),其中minor lineage是新发现的 ,与brambling聚集在一起。综上,至少核内5个基因在过去发生重配。
根据这核内基因的不用lineages,可以把现有的H7N9分成9个不同的基因型(genotypes)。
基因重配能迅速的交换遗传物质,改变其功能,比如增强致病性,传播性等。有必要及时对禽流感数据进行分析,观察其遗传变化路线图,以帮助我们更好阻止其进一步传播和致病。
Zhang L, Zhang Z, Weng Z. Rapid Reassortment of Internal Genes in Avian Influenza A(H7N9) Virus. Clinical Infectious Diseases 2013;57:1059-61.
Clin Infect Dis.-2013-Zhang-1059-61 (1).pdf
PS:之前已经写过这个文章内容, 稍微改了下,做个宣传,多交流!
Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )
GMT+8, 2024-5-21 21:38
Powered by ScienceNet.cn
Copyright © 2007- 中国科学报社