科学网上头条“中国近十年论文总引用次数超过四百万”，其中报道了十几个国家近十年引用次数最多的文章，竟然发现有两篇文章是生物信息文章，啥是惊讶，如下。

这几个工具是做序列分析，分子进化等方面常用的工具。近几年随着测序的猛烈发展，也强烈推动这些工具的发展，估计在未来几年这些工具引用次数也会激增。

这几个工具我都用过，PHYML与MEGA很早就使用过，DnaSP还是最近接触。PHYML PhyML_3.0_win32.exe主要是计算极大似然进化树，MEGA也是的,他还能计算NJ，MP等方法进化树，比PHYML强大很多。还有MEGA的最新版本MEGA5.03  MEGA5.03_Setup.exe集中很多其他功能，能序列比对，集合了clustalw与MUSCLE，还有一些其他一些序列分析功能，比如计算祖先，序列之间的距离等等。DnaSP dnasp51001.msi主要是序列分析，比如计算多态，序列间或各个位点的进化速度等等。

 

如果想学点生物信息与分子进化，或者想进这个领域，从学习MEGA和DnsSP是个不错的选择。 或者做分子方面的一些东西会使用这两个工具将会对工作有极大的帮助。这两个工具都有图形化界面，蛮傻瓜，比较好学。