2016年12月10-11日，全国生物系统学学术论坛在北京胜利饭店召开。来自全国科研单位400余人参加了会议，31位来自不同学科领域的专家、学者做了特邀报告，内容涵盖了动物、植物、微生物等不同类群系统学基础理论、大数据分析方法和学科发展等方面。由于年终总结、项目验收、期末考试等诸多原因，很多同行或研究生未能来北京参加论坛活动。他们和组委会成员都不约而同地想到了通过网络分享论坛现场视频的方法。可惜此次由于时间、人力和设备有限，我们没有能够录制相关视频。

会议最后通过了关于推动“全国生物系统学学术论坛”的倡议书。倡议书中第三点，特别指出：加强生物系统学青年人才的培养。激活国内外科研院所、高校生物系统学合作交流，并结合具体科研问题，邀请国内外专家举办培训班。建议中国教育部、中国科学院和国家自然科学基金委增加对生物系统学培训班的资助，邀请国内外知名专家就生物系统学的新理论、新方法和软件工具进行系统培训。

在准备实体生物系统学培训班之前，我们考虑先通过网络等多种方式，和国内同行，特别是青年学者、研究生分享一些国际上的专家的讲座（http://user.qzone.qq.com/425414123/main）。现在国外有一批年青学者，充分运用了网络和视频技术，邀请活跃在不同类群、不同方向的专家，远程录制了一批生物系统学的讲座视频，实现了全球共享（http://phyloseminar.org/）。

期待中国学者制作讲座视频进行分享；期待有更多的博士后、研究生围绕自己的课题，制作开题、中期和答辩的视频分享；期待提升生物系统学在大学本科阶段的科普程度；更期待中国生物系统学学者、研究生在新年里多建树、多分享！

附：报告人、报告题目、报告摘要（信息转载自http://phyloseminar.org/recorded.html）

Archaeaand Bacteria

Laura Hug  

University of Waterloo

Microbial diversity through a total community sequencing lens

2016年12月14日

Heterogeneoussubstitition

Nicholas Lartillot  

Université de Lyon

Systematic errors in phylogenomic studies: on the importance of modeling pattern-heterogeneity across sites.

2016年11月17日

Nathan Whelan  

US Fish and WildlifeService

Modeling substitutional heterogeneity and its impact on inferring relationships

2016年10月27日

Andrew Roger  

Dalhousie University

Combating phylogenetic artefacts by modelingsite-specific substitution processes with mixture models and approximations

2016年10月8日

History

Joe Felsenstein  

University of Washington

A brief history of computational phylogenetics

2016年8月5日

Structureand molecular evolution

Richard Goldstein  

University College London

What determines amino acid substitution rates?

2016年5月26日

Claus Wilke  

University of Texas atAustin

Structural and functional constraints on proteinevolution

2016年4月21日

Jesse Bloom  

Fred Hutch

Using experiments to inform phylogenetic models of substitution

2016年3月16日

Biasedsampling

Nicola De Maio  

University of Oxford

New routes to phylogeography: a Bayesian structured coalescent approximation

2016年3月2日

Vladimir Minin  

University of Washington

Preferential sampling through time when estimatingchanges in effective population size

2016年2月9日

Lea Popovic  

Concordia University

Ancestral features in trees with trait-dependent diversification

2016年1月6日

Phylo-geneticconservation

Sandrine Pavoine  

Muséum Nationald'Histoire Naturelle, Paris

Comparing patterns in phylogenetic and trait diversity

2015年12月9日

Catherine Graham  

Stony Brook University

Phylogenetic beta-diversity: a means to understand, mapand conserve spatial patterns of biological diversity

2015年11月5日

Arne Mooers  

Simon Fraser University

Conserving phylogenetic information: indices, approachesand gaps

2015年9月24日

Ebola

Gytis Dudas  

U Edinburgh

Ebola virus epidemiology, transmission, and viral evolution from four months of sequencing in Sierra Leone (Analysis and Methods)

2015年6月11日

Daniel Park  

Broad Institute

Ebola virus epidemiology, transmission, and viral evolution from four months of sequencing in Sierra Leone (Overview)

2015年5月13日

Ancestralrecombination graphs

Matthias Steinrücken

UMass Amherst

A demography-aware conditional sampling distribution for inferring ancient demography and detecting introgression patterns

2015年3月6日

Peter Ralph  

University of Southern California

An empirical view of the population pedigree

2015年1月29日

Matt Rasmussen  

Counsyl

Mathematical and visualization tools for working with ancestral recombination graphs

2014年12月17日

Viralphylodynamics

David Rasmussen  

ETH

Statistical inference for phylodynamics

2014年10月17日

Matthew Hall  

Edinburgh

Epidemic reconstruction in a phylogenetics framework

2014年10月10日

Erik Volz  

Imperial College London

Phylodynamics of infectious disease epidemics

2014年10月3日

Phylogeneticsof cancer

Roland Schwarz  

Cambridge

Phylogenetic quantification of intra-tumour heterogeneity

2014年6月20日

Kamila Naxerova  

Massachusetts GeneralHospital

Phylogenetic analysis of metastatic colon cancer inhumans

2014年6月6日

Mini-courseon genome-scale phylogeny

Eric Tannier  

INRIA, Université de Lyon

Evolution of genome organization

2014年5月1日

Bastien Boussau  

Université de Lyon

Gene tree-species tree methods for comparative genomics

2014年4月23日

Gergely Szöllősi  

Eötvös LorándTudományegyetem

Inferring gene trees with species trees

2014年4月16日

OpenTree of Life

Stephen Smith  

University of Michigan

Exploring graphs for mapping and synthesizing phylogenies

2014年2月14日

Karen Cranston  

National EvolutionarySynthesis Center

Technical and social challenges of synthesizing phylogenetic data across the tree of life

2014年2月7日

Integratingfossils into phylogenies

Graham Slater  

National Museum ofNatural History

Phylogenetic Paleobiology: What do we stand to gain from integrating fossils and phylogenies in macroevolutionary analyses?

2013年12月11日

Daniel Ksepka  

NESCENT

Including Fossil Taxa in Phylogenies: Advances and Issues

2013年12月4日

Tracy Heath  

UC Berkeley

The Fossilized Birth-Death Process: A Coherent Model of Fossil Calibration for Divergence Time Estimation

2013年11月15日

Inhonor of Carl Woese

Phil Hugenholtz  

University of Queensland

Carl Woese's grand view of life that just keeps getting grander

2013年6月28日

Ed DeLong

MIT

How Carl Woese transformed the field of microbial ecology

2013年5月14日

Norman R. Pace  

University of Colorado –Boulder

Following Carl Woese into the Natural Microbial World –The Beginnings of Metagenomics

2013年4月17日

Phylogeneticsand language

Thomas Currie  

University College London

Bobbins, Borrowing, and Bayesian Inference: Horizontal Transfer and the application of Phylogenetic Methods in Cultural Evolution studies

2013年3月12日

Fiona Jordan  

University of Bristol

Testing hypotheses about cultural evolution

2013年2月6日

Simon Greenhill  

Australian NationalUniversity

Language phylogenies and cultural evolution

2013年1月17日

Ratesand Dates

Hélène Morlon  

Ecole Polytechnique

Understanding biodiversity patterns using the Tree of Life

2012年12月6日

Tanja Gernhard Stadler

ETH Zurich

Inferring macroevolutionary processes based on phylogenetic trees

2012年9月20日

Structureand molecular evolution

David Pollock  

University of ColoradoSchool of Medicine

Adaptation, coevolution, and convergence in the context of protein thermodynamics

2012年5月31日

Richard Goldstein

National Institute forMedical Research, London

Simulating evolution with in silico models of protein thermodynamics

2012年5月1日

David Liberles  

U Wyoming

Protein Structural, Biophysical, and GenomicUnderpinnings of Protein Sequence Evolution

2012年3月29日

Software

John P. Huelsenbeck andSebastian Höhna

UC Berkeley and StockholmUniversity

RevBayes: An R like Environment for Bayesian phylogenetic inference

2012年3月1日

Sergei Kosakovsky Pond

UCSD

Introduction to HyPhy: Hypothesis testing using Phylogenies

2012年1月26日

Liam Revell and KlausSchliep  

UMass Boston andUniversity of Paris

Introduction to phytools and phangorn: phylogenetics tools for R

2011年12月16日

BeyondIID

Alexandre Bouchard-Côté

U British Columbia

The Poisson Indel Process

2011年10月19日

Oscar Westesson  

UC Berkeley

Accurate reconstruction of insertion-deletion historiesby statistical phylogenetics

2011年9月21日

Evolutionarygenomics

Jason Stajich  

UC Riverside

Fungal phylogenomics: Getting lost in the moldy forest

2011年6月29日

Adam Siepel  

Cornell

Bayesian inference of ancient human demography from individual genome sequences

2011年5月24日

Mike Lin  

MIT

Locating protein-coding sequences under selection for additional, overlapping functions in 29 mammalian genomes

2011年4月26日

Macroevolution

Brian O'Meara  

U Tennessee

Making comparative methods as easy as ABC

2011年3月30日

Luke Harmon  

U Idaho

New Frontiers for the Comparative Analysis of Diversification

2011年2月25日

Joe Felsenstein  

U Washington

What poultry breeders and guinea pigs have to tell usabout statistical nonmolecular phylogenetics

2011年1月24日

Infectiousdisease

Sergei Kosakovsky Pond

UCSD

Accurate estimation of evolutionary attributes of coding sequencesand evolutionary fingerprinting

2010年10月28日

Marco Salemi  

U Florida

Phylogenetic challenges in the retroviridae branch of the tree of life

2010年9月20日

Philippe Lemey  

KU Leuven

Phylogenetic diffusion models and their applications inviral epidemiology

2010年9月10日

Trevor Bedford  

U Edinburgh

Adaptation and migration in the human influenza virus

2010年4月23日

Gene-treespecies-tree

Jens Lagergren  

KTH

Probabilistic Analysis of gene families with respect togene duplication, loss, and transfer

2010年3月29日

Noah Rosenberg  

Stanford

Consistency properties of species tree inference algorithms under the multispecies coalescent

2010年2月24日

Joseph Heled  

U Auckland

The end of lineage sorting: inferring species trees using*BEAST

2010年1月25日

Alignment

Ward Wheeler  

AMNH

Dynamic homology and phylogenetic systematics

2009年12月7日

Marc Suchard  

UCLA

A Bayesian perspective on alignment

2009年11月18日