最近在和南方科大商量要建一个基因中心(Genome Center)，基于自己的工作经验，草拟了一个仪器列表，供大家参考。这个列表主要参考了两个基因中心，一个是我现在实验室的位于Institute of Stem cell at Stanford University，另外一个是Michael Snyder实验室。这些仪器我都亲自使用过。

1, Illumina Hiseq(一台). 毫无疑问，任何一个基因中心必备的仪器。一次测序需10天，数据量高达600G，数据可靠放心，适合做Human Genome。华大基因就是靠这个起家的。售价为50万美元。

2， Illumina Miseq(两台)， 是Hiseq的微型版，只需2天就可测一次。性能稳定，数据可靠。 适合做Target sequencing. 价格为12万美元左右，比较适合医院和小型研究机构使用。

3, Ion Torrent (两台). 刚出不久的测序仪，售价5万美元。 用的是和其他测序仪完全不同的半导体技术，大家对他非常看好，虽然目前数据量产出还很低，但前景非常好。预计两年后能达到Roche 454的测序长度和数据量。最大的优点是测试时间短，两天就可测一次。我昨天刚和Ion Torrent的技术总监讨论了一下，感觉他们的产品开发速度非常快，我很看好。

4， Roche 454  (一台), 这个其实挺纠结的。首先，我现在的项目一直在用Roche 454，效果很好，数据很理想。可是就是用起来贵了点，跑一次要8千美元，而且454一直无法把成本降下来。所有我正犹豫是否只买个微型版的Roche 454 Junior来过渡。

前段时间很火的PacBio不在我的单子里。PacBio是一个让我相当失望的测序平台。我现在的实验室测试了至少20次，没有哪次的结果能用的。

 

 

 

 

 

 

 

 

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