引起成人社区获得性肺炎的人55型腺病毒的比较基因组学研究：疫苗开发与感染人群分布变化的分析

近日，《Frontiers in Microbiology》在线发表了南方医科大学张其威教授课题组、中日友好医院曹彬教授合作的研究结果：《Comparative Genomic Analysis of Re-emergent Human Adenovirus Type 55 Pathogens Associated With Adult Severe Community-Acquired Pneumonia Reveals Conserved Genomes and Capsid Proteins》。

人55型腺病毒（HAdV-B55）是近年来鉴定的一种引起急性呼吸道疾病的病原体，它属于腺病毒B种，基因组是由引起肾脏疾病的人11型腺病毒（HAdV-B11）和引起呼吸道疾病的人14型腺病毒（HAdV-B14）重组而来（HAdV-B14的具体起源研究见先前报道：https://mp.weixin.qq.com/s/mmFqCD8VxFhh2No7IEwq6g）。自2006年HAdV-B55首次在中国某中学引起暴发以来，一直没有进一步的相关报道，直到2011年，在中国北京暴发了成人重症社区获得性肺炎(CAP)。随后，HAdV-B55腺病毒在成人以及军队新兵中多次引起肺炎等呼吸道感染大暴发。本研究利用生物信息学方法分析阐述了再现的引起这次暴发的HAdV-B55流行株。首先，重组和蛋白序列分析再次证实了本次分离的人55型腺病毒（BJ01株）是含有HAdV-B11衣壳六邻体基因的重组病毒。三个衣壳蛋白（六邻体、五邻体基部、纤维蛋白）基因的进化均为负选择，其非同义突变和同义突变的比率均很低(<0.0007)。HAdV-B55的全基因组、三个主要衣壳蛋白基因的进化分析揭示，它与其它所有已知HAdV-B55流行株之间的亲缘关系非常近。比较基因组学分析了2011年再现的人55型腺病毒BJ01株与2006年发现的第一株人55型腺病毒QS-DLL株，结果表明，两株病毒有很高的核苷酸同源性(99.87%)，差异仅包括10个单核苷酸非同义突变，11个同义替换，3个插入和1个非编码区的缺失。10个非同义替换中有6个发生在L3区的pVI蛋白上，该蛋白在腺病毒感染的不同阶段发挥不同的作用，这些氨基酸突变可能与最近流行的HAdV-B55株感染的人群分布变化有关。而与型特异性中和抗体产生相关的三个主要衣壳蛋白没有出现非同义替换。再现的引起成人重症社区获得性肺炎的HAdV-B55的比较基因组分析，揭示了该病毒基因组和衣壳蛋白的保守，这为今后该病原体的疫苗的开发奠定了理论基础；同时，有助于进一步开展HAdV-B55的流行病学、分子进化、病原体出现与再现模式的研究，以及预测腺病毒间的基因组重组。

2018年6月5日发表的论文全文：https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2018.01180/full

FIGURE 1. Transcriptional map and genome organization of HAdV-B55 strain BJ01.

FIGURE 4. Schematic representation of HAdV-B55 protein VI.