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本地blast的bat批处理文件
#作者信息
熊荣川
六盘水师范学院生物信息学实验室
六盘水市生物研究所
xiongrongchuan@126.com
http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz
在生物信息分析,或者个发育分析中经常使用到NCBI本地blast
(例如ncbi-blast-2.2.27+)
但是一般让人望而生畏的是其非友好的使用界面
下面提供一个批处理文件,方便大家使用
代码如下
makeblastdb -in infile.fas -input_type fasta -dbtype nucl -title ORFtestGO -out outdb
#infile.fas 为你构建本地DNA数据库的fasta文件
#outdb 为你构建的数据名称
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GMT+8, 2024-9-14 16:19
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