沉闷科学的掘墓人分享 http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz

博文

Bioedit可以搜索并报告序列的保守区域

已有 11362 次阅读 2012-4-9 16:29 |个人分类:我的研究|系统分类:科研笔记| 搜索, 报告, 序列, Bioedit, 保守区域

Bioedit可以搜索并报告序列的保守区域

 

熊荣川

六盘水师范学院生物信息学实验室

xiongrongchuan@126.com

http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz

 

在分子生物学研究中,我常常通过比对序列来寻找序列之间的保守区域(碱基或氨基酸不变的区域),例如设计引物等。但是比对完之后,常常是通过肉眼寻找保守区域,工作量大不说,往往会有所遗漏,其实Bioedit就能搜索并报告序列的保守区域,下面我们将图解其过程

为了图文并貌,请下载pdf文件查看

Bioedit可以搜索并报告序列的保守区域.pdf

 

 

打开Bioedit之后选择“比对———查找保守区”

设置保守区域搜索参数,例如保守区域长度最小值,是否允许空格等等

弹出的结果框分区域显示了保守区域的信息。

 

就这么简单,祝您科研愉快!



https://blog.sciencenet.cn/blog-508298-557198.html

上一篇:fastr格式DNA序列的多序列处理
下一篇:批量去掉文档中的回车(换行符)
收藏 IP: 210.75.236.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (3 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-11-24 17:37

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部