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将fastr格式序列转化为整体字体串（使用R语言）
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将fastr格式序列转化为整体字体串（使用R语言）
熊荣川
六盘水师范学院生物信息学实验室
http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz
之前我们写的很多R语言程序在处理序列输入时，推荐较为简单的fastr格式
http://bbs.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=508298&do=blog&id=553655
但是这种序列导入R语言平台是，由于对每一行字符数的限制，整体序列被分割成很多单元（每单元最多70个字符），如果直接进行字符串操作则会由于这些分割而不能顺利运算。这里我们通过一段代码将fastr格式的序列成功连接成一个整体字符串。
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data <- readLines("D:\ziliao\zhuanye\R bear\isk2.fastr") |
导入fastr格式序列 |
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x=data |
将data赋值个x，避免由于运算而变化data内容，再次需要的时候还有输入那段冗长命令 |
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y=x[1] |
初始化我们的y值，使得y为一个合适的字符变量 |
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for (i in 2:length(x)) { y=paste(y, x[i], sep = "") } |
从x的第二个单元开始逐一合并到y上，最终成为一个整体 |
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length(y) [1] 1 |
检验y的整体性 |
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nchar(y) [1] 349 |
查看y的完成性
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https://blog.sciencenet.cn/blog-508298-553858.html
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