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如何用bash脚本批量提交多组任务

已有 5565 次阅读 2018-4-8 21:31 |个人分类:计算机|系统分类:科研笔记| bash, 提交任务, 多组

涉及到sed脚本内引用变量:

http://www.cnblogs.com/gx-303841541/archive/2012/10/25/2738029.html

# job.sh
# change the random number in pr.mdp
for i in {1..4}
do
cp -r run0 run${i}
cd run${i}
k=$(($i*2000))
sed "s/140000/${k}/g" ../pr.mdp > pr.mdp
grompp -f pr.mdp -c pr.gro -p abeta.top -o md.tpr
qsub -N c1_p2md${i} -pe norte 24 -q thin.q -cwd -V -b y mdrun -nt 24 -deffnm md
cd ..
done




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