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人体内的金属一般是以水合离子的形式存在的。
当其与蛋白结合的时候,涉及的是水合层与氨基酸的竞争。一般氨基酸的构型也要满足合适的配位方式才能与水合层进行竞争。
为了研究氨基酸的空间构型,需要了解各种金属离子水合层的结合方式,包括形成配位的强度,以及第一水壳层中水的数目等。
这篇论文中做了综述:
https://www.iupac.org/publications/pac/pdf/2010/pdf/8210x1901.pdf
也有一些网站进行了很好的可视化整理,以potassium为例:
https://www.webelements.com/potassium/atom_sizes.html
更多元素周期表的图。
potassium也有不同的配位方式,8配位时,其半径为1.65 Å。这个怎么算的?基于O2- 的半径为1.4 Å。
https://www.webelements.com/periodicity/ionic_radius_1_8_coord/
但其他配位方式对应的并不是水合状态。比如四面体结构:
https://www.webelements.com/compounds/potassium/dipotassium_sulphide.html
题外话,potassium原子半径为2.43 Å,这个怎么计算的?参见
https://www.webelements.com/periodicity/atomic_radius/
可知,是通过自洽场方式进行理论计算出来的,因为实验上无法得到孤立的单原子。
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GMT+8, 2024-9-15 15:12
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