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· 检测NK细胞killing activity用chromium-51release assay (Ohio Stat Univ)
· AML:克隆数越多预后越差;NPM1突变可作为预后指标(Yale)
· B细胞发育与VDJ重排:HPC-> LPC - D/J重排-> Pro-B - V/DJ重排 ->Pre-B -> 轻链重排 -> Naïve B (t-gen)
· 相比于ABC-DLBCL,GNA13通路变异在GCB-DLBCL中更显著,P2RY8,GNA13和ARHGEF1都有显著差异
· 斯坦福大学研究组开发的CAPP-Seq可用于检测外周血ctDNA,通过数学建模甚至可以估算克隆大小;数学模型包含淋巴瘤细胞生长速度(分裂速度– 死亡速度)和ctDNA增长速度(ctDNA生成– ctDNA降解)
· 对>2000病例调查显示,MyeloidNeoplasm中有高频DDX41突变,且在亚洲人群中频率更好(亚洲:4.1%;高加索:1.5%)
· Mir-155靶基因:CEBP-beta, SOCS, SHIP-1, Jarid2,PU.1
· MYD88和CD79B激活突变可作为ABC-DLBCL对ibrutinib抗性的预后指标(Abstract#2759)
· Flow cytometry结果显示PTCL-NOS全部为CD8阴性,其中一半为CD4阳性;AITL中83%为CD4+CD8-,11%为CD4-CD8+,6%双阴性(是否是诊断问题?)
· 来自Pharmacyclics LLC的Ibrutinib治疗病人靶向测序分析(Abstract#2642)调查了cooperativemutated genes,ABC-DLBCL中比较显著的有CD79B/MYD88, BCL6/MYD88,CCND3/CD79B, CCND3/CDKN2B, CCDN3/MYD88, CD79B/NOTCH1, BCL6/CD79B, CDKN2B/MYD88,CDKN2A/CDKN2B, BCL6/MLL2, CDKN2A/PIM1
· 调查8334正常人基因组作为对照,以解决DLBCL缺少normal的问题(假阳性率每Mb基因组区域3个)(Dana-Farber)
· STAT6在滤泡性淋巴瘤(FL)突变率为13%,其中D419为其热点;D419突变可提高CD23转录水平
· GATA-3、T-bet和Ki-67表达水平可作为PTCL-NOS分类指标(#3889)
· DLBCL的stroma cell中可见clonal的T细胞受体
· 剪切体包含多个因子,这些因子的突变常常是互斥的(mutuallyexclusive)(Yoshida et al, Nature, 2011, 478:64-9)
· 用ATAC-seq研究enhancer貌似不错,只需要很少的细胞数
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