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eQTL的精细定位和图位克隆

已有 10031 次阅读 2014-12-11 20:19 |个人分类:QTL精细定位|系统分类:科研笔记

     我的和彩云笔记,提供了这样一个例子,笔记的最后提供了全文(http://mnote.weibo.10086.cn/share/sharenote.html?id=c1e0f16c76b9abeb05f2713b1eb53e04).文章为:

http://www.plantcell.org/content/early/2014/08/12/tpc.114.128512.abstract

eQTL Mapping of Transposon Silencing Reveals a Position-Dependent Stable Escape from Epigenetic Silencing and Transposition of AtMu1 in the Arabidopsis Lineage

    第一次看到eQTL的精细定位和图位克隆。所以这篇文章,值得收藏。所谓eQTL就是把基因的表达量当成一种表型,影响这个表型的QTL叫eQTL.QTL作图的关键在于基因型和表型,现在基因型鉴定已经实现高通量和自动化了,所以作图的限制因素在表型。传统概念中的表型如株高,产量等测定大多还没实现自动化,但是如果从eQTL的角度来考虑,基因表达数据的可以大规模高通量的进行。如果,可以快速的确定eQTL对应的基因(序列),那么对eQTL的研究有可能比普通QTL的研究更迅速和深入。这篇文章的意义就在于提供了一个范例,今后估计会不断的有类似的文章出来。



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