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例如:cut -f 1,2,3,4,5,6,7,8 Cul_Wild_1529lines.chr2>1529snp_chr2
这个文件有1529+8=1537列,前8列如下:
Chromosome | Position | RefBase | SnpBase | TotalHitNum | MAF | RefNum | SnpNum |
---|
后1529列为不同品种在相应位置的SNP。文件Cul_Wild_1529lines.chr2的大小为2.3G,后面产生的1529snp_chr2的文件大小为33.2M。这个就小多了,可以把所有数据导入一个SQL或者MySQL数据库。就这样一个看似简单的命令,完成的工作,可不那么简单。这可能是Linux的魅力。
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GMT+8, 2024-10-20 06:02
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